CLSTN2

CLSTN2
Ідентифікатори
Символи	CLSTN2, ALC-GAMMA, CDHR13, CS2, CSTN2, alcagamma, calsyntenin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 611323 MGI: 1929897 HomoloGene: 49698 GeneCards: CLSTN2
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз, короткозорість, лімфогранульоматоз
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • cell surface • Golgi membrane • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • клітинна мембрана • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic density membrane Біологічний процес • адгезія клітин • positive regulation of synaptic transmission • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • positive regulation of synapse assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64084	64085
Ensembl	ENSG00000158258	ENSMUSG00000032452
UniProt	Q9H4D0	Q9ER65
RefSeq (мРНК)	NM_022131	NM_022319
RefSeq (білок)	NP_071414	NP_071714
Локус (UCSC)	Хр. 3: 139.94 – 140.58 Mb	Хр. 9: 97.33 – 97.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLSTN2 (англ. Calsyntenin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 955 амінокислот, а молекулярна маса — 107 006.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLPGRLCWVP		LLLALGVGSG		SGGGGDSRQR		RLLAAKVNKH		KPWIETSYHG
VITENNDTVI		LDPPLVALDK		DAPVPFAGEI		CAFKIHGQEL		PFEAVVLNKT
SGEGRLRAKS		PIDCELQKEY		TFIIQAYDCG		AGPHETAWKK		SHKAVVHIQV
KDVNEFAPTF		KEPAYKAVVT		EGKIYDSILQ		VEAIDEDCSP		QYSQICNYEI
VTTDVPFAID		RNGNIRNTEK		LSYDKQHQYE		ILVTAYDCGQ		KPAAQDTLVQ
VDVKPVCKPG		WQDWTKRIEY		QPGSGSMPLF		PSIHLETCDG		AVSSLQIVTE
LQTNYIGKGC		DRETYSEKSL		QKLCGASSGI		IDLLPSPSAA		TNWTAGLLVD
SSEMIFKFDG		RQGAKVPDGI		VPKNLTDQFT		ITMWMKHGPS		PGVRAEKETI
LCNSDKTEMN		RHHYALYVHN		CRLVFLLRKD		FDQADTFRPA		EFHWKLDQIC
DKEWHYYVIN		VEFPVVTLYM		DGATYEPYLV		TNDWPIHPSH		IAMQLTVGAC
WQGGEVTKPQ		FAQFFHGSLA		SLTIRPGKME		SQKVISCLQA		CKEGLDINSL
ESLGQGIKYH		FNPSQSILVM		EGDDIGNINR		ALQKVSYINS		RQFPTAGVRR
LKVSSKVQCF		GEDVCISIPE		VDAYVMVLQA		IEPRITLRGT		DHFWRPAAQF
ESARGVTLFP		DIKIVSTFAK		TEAPGDVKTT		DPKSEVLEEM		LHNLDFCDIL
VIGGDLDPRQ		ECLELNHSEL		HQRHLDATNS		TAGYSIYGVG		SMSRYEQVLH
HIRYRNWRPA		SLEARRFRIK		CSELNGRYTS		NEFNLEVSIL		HEDQVSDKEH
VNHLIVQPPF		LQSVHHPESR		SSIQHSSVVP		SIATVVIIIS		VCMLVFVVAM
GVYRVRIAHQ		HFIQETEAAK		ESEMDWDDSA		LTITVNPMEK		HEGPGHGEDE
TEGEEEEEAE		EEMSSSSGSD		DSEEEEEEEG		MGRGRHGQNG		ARQAQLEWDD
STLPY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3