CNTN1

CNTN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EE2, 3S97
Ідентифікатори
Символи	CNTN1, F3, GP135, MYPCN, contactin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600016 MGI: 105980 HomoloGene: 7274 GeneCards: CNTN1
Пов'язані генетичні захворювання
Compton-North congenital myopathy
Онтологія гена Молекулярна функція • carbohydrate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • myelin sheath • anchored component of membrane • membrane raft • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • anchored component of postsynaptic membrane • anchored component of presynaptic membrane Біологічний процес • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • нейробіологія розвитку • адгезія клітин • GO:1901313 positive regulation of gene expression • neuron projection development • GO:0061423 positive regulation of sodium ion transport • cerebellum development • positive regulation of neuron projection development • Сигнальний шлях Notch Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1272	12805
Ensembl	ENSG00000018236	ENSMUSG00000055022
UniProt	Q12860	P12960
RefSeq (мРНК)	NM_001256063 NM_001256064 NM_001843 NM_175038	NM_001159647 NM_001159648 NM_007727 NM_001358051
RefSeq (білок)	NP_001242992 NP_001242993 NP_001834 NP_778203	NP_001153119 NP_001153120 NP_031753 NP_001344980
Локус (UCSC)	Хр. 12: 40.69 – 41.07 Mb	Хр. 15: 91.95 – 92.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNTN1 (англ. Contactin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 018 амінокислот, а молекулярна маса — 113 320.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKMWLLVSHL		VIISITTCLA		EFTWYRRYGH		GVSEEDKGFG		PIFEEQPINT
IYPEESLEGK		VSLNCRARAS		PFPVYKWRMN		NGDVDLTSDR		YSMVGGNLVI
NNPDKQKDAG		IYYCLASNNY		GMVRSTEATL		SFGYLDPFPP		EERPEVRVKE
GKGMVLLCDP		PYHFPDDLSY		RWLLNEFPVF		ITMDKRRFVS		QTNGNLYIAN
VEASDKGNYS		CFVSSPSITK		SVFSKFIPLI		PIPERTTKPY		PADIVVQFKD
VYALMGQNVT		LECFALGNPV		PDIRWRKVLE		PMPSTAEIST		SGAVLKIFNI
QLEDEGIYEC		EAENIRGKDK		HQARIYVQAF		PEWVEHINDT		EVDIGSDLYW
PCVATGKPIP		TIRWLKNGYA		YHKGELRLYD		VTFENAGMYQ		CIAENTYGAI
YANAELKILA		LAPTFEMNPM		KKKILAAKGG		RVIIECKPKA		APKPKFSWSK
GTEWLVNSSR		ILIWEDGSLE		INNITRNDGG		IYTCFAENNR		GKANSTGTLV
ITDPTRIILA		PINADITVGE		NATMQCAASF		DPALDLTFVW		SFNGYVIDFN
KENIHYQRNF		MLDSNGELLI		RNAQLKHAGR		YTCTAQTIVD		NSSASADLVV
RGPPGPPGGL		RIEDIRATSV		ALTWSRGSDN		HSPISKYTIQ		TKTILSDDWK
DAKTDPPIIE		GNMEAARAVD		LIPWMEYEFR		VVATNTLGRG		EPSIPSNRIK
TDGAAPNVAP		SDVGGGGGRN		RELTITWAPL		SREYHYGNNF		GYIVAFKPFD
GEEWKKVTVT		NPDTGRYVHK		DETMSPSTAF		QVKVKAFNNK		GDGPYSLVAV
INSAQDAPSE		APTEVGVKVL		SSSEISVHWE		HVLEKIVESY		QIRYWAAHDK
EEAANRVQVT		SQEYSARLEN		LLPDTQYFIE		VGACNSAGCG		PPSDMIEAFT
KKAPPSQPPR		IISSVRSGSR		YIITWDHVVA		LSNESTVTGY		KVLYRPDGQH
DGKLYSTHKH		SIEVPIPRDG		EYVVEVRAHS		DGGDGVVSQV		KISGAPTLSP
SLLGLLLPAF		GILVYLEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Reid R.A., Bronson D.D., Young K.M., Hemperly J.J. (1994). Identification and characterization of the human cell adhesion molecule contactin. Brain Res. Mol. Brain Res. 21: 1—8. PMID 8164510 DOI:10.1016/0169-328X(94)90372-7
• Berglund E.O., Ranscht B. (1994). Molecular cloning and in situ localization of the human contactin gene (CNTN1) on chromosome 12q11-q12. Genomics. 21: 571—582. PMID 7959734 DOI:10.1006/geno.1994.1316
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Berglund E., Stigbrand T., Carlsson S.R. (1991). Isolation and characterization of a membrane glycoprotein from human brain with sequence similarities to cell adhesion proteins from chicken and mouse. Eur. J. Biochem. 197: 549—554. PMID 2026173 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb15943.x
• Bouyain S., Watkins D.J. (2010). The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2443—2448. PMID 20133774 DOI:10.1073/pnas.0911235107

Див. також

• Хромосома 12