CNTN5

CNTN5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4N68
Ідентифікатори
Символи	CNTN5, HNB-2s, NB-2, contactin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 607219 MGI: 3042287 HomoloGene: 28447 GeneCards: CNTN5
Пов'язані генетичні захворювання
короткозорість, натуральна віспа
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53942	244682
Ensembl	ENSG00000149972	ENSMUSG00000039488
UniProt	O94779	P68500
RefSeq (мРНК)	NM_001243270 NM_001243271 NM_014361 NM_175566	NM_001033359 NM_001170787
RefSeq (білок)	NP_001230199 NP_001230200 NP_055176 NP_780775	NP_001028531 NP_001164258
Локус (UCSC)	Хр. 11: 99.02 – 100.36 Mb	Хр. 9: 9.66 – 10.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNTN5 (англ. Contactin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 100 амінокислот, а молекулярна маса — 120 686.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSWKLMLF		LSVTMCLSEY		SKSLPGLSTS		YAALLRIKKS		SSSSLFGSKT
RPRYSSPSLG		TLSASSPSWL		GAAQNYYSPI		NLYHSSDAFK		QDESVDYGPV
FVQEPDDIIF		PTDSDEKKVA		LNCEVRGNPV		PSYRWLRNGT		EIDLESDYRY
SLIDGTFIIS		NPSEAKDSGH		YQCLATNTVG		SILSREATLQ		FAYLGNFSGR
TRSAVSVREG		QGVVLMCSPP		PHSPEIIYSW		VFNEFPSFVA		EDSRRFISQE
TGNLYISKVQ		TSDVGSYICL		VKNTVTNARV		LSPPTPLTLR		NDGVMGEYEP
KIEVHFPFTV		TAAKGTTVKM		ECFALGNPVP		TITWMKVNGY		IPSKARLRKS
QAVLEIPNVQ		LDDAGIYECR		AENSRGKNSF		RGQLQVYTYP		HWVEKLNDTQ
LDSGSPLRWE		CKATGKPRPT		YRWLKNGVPL		SPQSRVEMVN		GVLMIHNVNQ
SDAGMYQCLA		ENKYGAIYAS		AELKILASAP		TFALNQLKKT		IIVTKDQEVV
IECKPQGSPK		PTISWKKGDR		AVRENKRIAI		LPDGSLRILN		ASKSDEGKYV
CRGENVFGSA		EIIASLSVKE		PTRIELTPKR		TELTVGESIV		LNCKAIHDAS
LDVTFYWTLK		GQPIDFEEEG		GHFESIRAQA		SSADLMIRNI		LLMHAGRYGC
RVQTTADSVS		DEAELLVRGP		PGPPGIVIVE		EITESTATLS		WSPAADNHSP
ISSYNLQARS		PFSLGWQTVK		TVPEIITGDM		ESAMAVDLNP		WVEYEFRVVA
TNPIGTGDPS		TPSRMIRTNE		AVPKTAPTNV		SGRSGRRHEL		VIAWEPVSEE
FQNGEGFGYI		VAFRPNGTRG		WKEKMVTSSE		ASKFIYRDES		VPPLTPFEVK
VGVYNNKGDG		PFSQIVVICS		AEGEPSAAPT		DVKATSVSVS		EILVAWKHIK
ESLGRPQGFE		VGYWKDMEQE		DTAETVKTRG		NESFVILTGL		EGNTLYHFTV
RAYNGAGYGP		PSSEVSATTK		KSPPSQAPSN		LRWEQQGSQV		SLGWEPVIPL
ANESEVVGYK		VFYRQEGHSN		SQVIETQKLQ		AVVPLPDAGV		YIIEVRAYSE
GGDGTASSQI		RVPSYSGGKI		TSAQSTLHSL		STSSSSVTLL		LALMIPSTSW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліпопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bouyain S., Watkins D.J. (2010). The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2443—2448. PMID 20133774 DOI:10.1073/pnas.0911235107

Див. також

• Хромосома 11