COBLL1

COBLL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DAJ
Ідентифікатори
Символи	COBLL1, COBLR1, cordon-bleu WH2 repeat protein like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610318 MGI: 2442894 HomoloGene: 8933 GeneCards: COBLL1
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • actin monomer binding • cadherin binding Клітинна компонента • екзосома Біологічний процес • actin filament network formation • actin filament polymerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22837	319876
Ensembl	ENSG00000082438	ENSMUSG00000034903
UniProt	Q53SF7	Q3UMF0
RefSeq (мРНК)	NM_014900 NM_001278458 NM_001278460 NM_001278461	NM_027225 NM_177025 NM_001363076 NM_001363077
RefSeq (білок)	NP_001265387 NP_001265389 NP_001265390 NP_055715 NP_001352599 NP_001352600 NP_001352601 NP_001352602 NP_001352603 NP_001352604	NP_081501 NP_795999 NP_001350005 NP_001350006
Локус (UCSC)	Хр. 2: 164.65 – 164.84 Mb	Хр. 2: 64.92 – 65.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COBLL1 (англ. Cordon-bleu WH2 repeat protein like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 204 амінокислот, а молекулярна маса — 131 787.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCGRAAEAAA		SSRTPGREMG		QAVTRRLGAG		ARAAPRRAMD		GRTPRPQDAP
ARRKPKAKAP		LPPAETKYTD		VSSAADSVES		TAFIMEQKEN		MIDKDVELSV
VLPGDIIKST		TVHGSKPMMD		LLIFLCAQYH		LNPSSYTIDL		LSAEQNHIKF
KPNTPIGMLE		VEKVILKPKM		LDKKKPTPII		PEKTVRVVIN		FKKTQKTIVR
VSPHASLQEL		APIICSKCEF		DPLHTLLLKD		YQSQEPLDLT		KSLNDLGLRE
LYAMDVNRES		CQISQNLDIM		KEKENKGFFS		FFQRSKKKRD		QTASAPATPL
VNKHRPTFTR		SNTISKPYIS		NTLPSDAPKK		RRAPLPPMPA		SQSVPQDLAH
IQERPASCIV		KSMSVDETDK		SPCEAGRVRA		GSLQLSSMSA		GNSSLRRTKR
KAPSPPSKIP		PHQSDENSRV		TALQPVDGVP		PDSASEANSP		EELSSPETFH
PGLSSQEQCT		APKLMEETSV		FECPGTPEAA		ITSLTSGISS		DYSLEEIDEK
EELSEVPKVE		AENISPKSQD		IPFVSTDIIN		TLKNDPDSAL		GNGSGEFSQN
SMEEKQETKS		TDGQEPHSVV		YDTSNGKKVV		DSIRNLKSLG		PNQENVQNEI
IVYPENTEDN		MKNGVKKTEI		NVEGVAKNNN		IDMEVERPSN		SEAHETDTAI
SYKENHLAAS		SVPDQKLNQP		SAEKTKDAAI		QTTPSCNSFD		GKHQDHNLSD
SKVEECVQTS		NNNISTQHSC		LSSQDSVNTS		REFRSQGTLI		IHSEDPLTVK
DPICAHGNDD		LLPPVDRIDK		NSTASYLKNY		PLYRQDYNPK		PKPSNEITRE
YIPKIGMTTY		KIVPPKSLEI		SKDWQSETIE		YKDDQDMHAL		GKKHTHENVK
ETAIQTEDSA		ISESPEEPLP		NLKPKPNLRT		EHQVPSSVSS		PDDAMVSPLK
PAPKMTRDTG		TAPFAPNLEE		INNILESKFK		SRASNAQAKP		SSFFLQMQKR
VSGHYVTSAA		AKSVHAAPNP		APKELTNKEA		ERDMLPSPEQ		TLSPLSKMPH
SVPQPLVEKT		DDDVIGQAPA		EASPPPIAPK		PVTIPASQVS		TQNLKTLKTF
GAPRPYSSSG		PSPFALAVVK		RSQSFSKERT		ESPSASALVQ		PPANTEEGKT
HSVNKFVDIP		QLGVSDKENN		SAHNEQNSQI		PTPTDGPSFT		VMRQSSLTFQ
SSDPEQMRQS		LLTAIRSGEA		AAKLKRVTIP		SNTISVNGRS		RLSHSMSPDA
QDGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 2