COLEC11

COLEC11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4YLI, 4YMD
Ідентифікатори
Символи	COLEC11, 3MC2, CL-K1-I, CL-K1-II, CL-K1-IIa, CL-K1-IIb, CLK1, collectin subfamily member 11, CL-11
Зовнішні ІД	OMIM: 612502 MGI: 1918943 HomoloGene: 11423 GeneCards: COLEC11
Пов'язані генетичні захворювання
3MC syndrome 2
Онтологія гена Молекулярна функція • mannose binding • carbohydrate binding • serine-type endopeptidase activity • DNA binding • calcium ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • fucose binding • oligosaccharide binding • calcium-dependent carbohydrate binding • зв'язування з іоном металу • monosaccharide binding Клітинна компонента • extracellular region • Колаген • міжклітинний простір Біологічний процес • multicellular organism development • рецептор-опосередкований ендоцитоз • complement activation • протеоліз • complement activation, lectin pathway • GO:0007571 розвойовий процес • antimicrobial humoral response • execution phase of apoptosis • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	78989	71693
Ensembl	ENSG00000118004	ENSMUSG00000036655
UniProt	Q9BWP8	Q3SXB8
RefSeq (мРНК)	NM_001255982 NM_001255983 NM_001255984 NM_001255985 NM_001255986 NM_001255987 NM_001255988 NM_001255989 NM_024027 NM_199235	NM_027866 NM_001313978
RefSeq (білок)	NP_001242911 NP_001242912 NP_001242913 NP_001242914 NP_001242915 NP_001242916 NP_001242917 NP_001242918 NP_076932 NP_954705	NP_001300907 NP_082142
Локус (UCSC)	Хр. 2: 3.59 – 3.64 Mb	Хр. 12: 28.64 – 28.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COLEC11 (англ. Collectin subfamily member 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 271 амінокислот, а молекулярна маса — 28 665.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGNLALVGV		LISLAFLSLL		PSGHPQPAGD		DACSVQILVP		GLKGDAGEKG
DKGAPGRPGR		VGPTGEKGDM		GDKGQKGSVG		RHGKIGPIGS		KGEKGDSGDI
GPPGPNGEPG		LPCECSQLRK		AIGEMDNQVS		QLTSELKFIK		NAVAGVRETE
SKIYLLVKEE		KRYADAQLSC		QGRGGTLSMP		KDEAANGLMA		AYLAQAGLAR
VFIGINDLEK		EGAFVYSDHS		PMRTFNKWRS		GEPNNAYDEE		DCVEMVASGG
WNDVACHTTM		YFMCEFDKEN		M

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2