COLEC12

COLEC12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OX8
Ідентифікатори
Символи	COLEC12, CLP1, NSR2, SCARA4, SRCL, collectin subfamily member 12
Зовнішні ІД	OMIM: 607621 MGI: 2152907 HomoloGene: 34248 GeneCards: COLEC12
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0008329 pattern recognition receptor activity • galactose binding • зв'язування з іоном металу • low-density lipoprotein particle binding • scavenger receptor activity • carbohydrate binding Клітинна компонента • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • колаген • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • defense response • positive regulation of cell adhesion molecule production • carbohydrate mediated signaling • рецептор-опосередкований ендоцитоз • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to exogenous dsRNA • phagocytosis, recognition • вроджений імунітет • toll-like receptor 3 signaling pathway • protein homooligomerization • regulation of immune response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81035	140792
Ensembl	ENSG00000158270	ENSMUSG00000036103
UniProt	Q5KU26	Q8K4Q8
RefSeq (мРНК)	NM_030781 NM_130386	NM_130449
RefSeq (білок)	NP_569057	NP_569716
Локус (UCSC)	Хр. 18: 0.32 – 0.5 Mb	Хр. 18: 9.71 – 9.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COLEC12 (англ. Collectin subfamily member 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 742 амінокислот, а молекулярна маса — 81 515.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKDDFAEEEE		VQSFGYKRFG		IQEGTQCTKC		KNNWALKFSI		ILLYILCALL
TITVAILGYK		VVEKMDNVTG		GMETSRQTYD		DKLTAVESDL		KKLGDQTGKK
AISTNSELST		FRSDILDLRQ		QLREITEKTS		KNKDTLEKLQ		ASGDALVDRQ
SQLKETLENN		SFLITTVNKT		LQAYNGYVTN		LQQDTSVLQG		NLQNQMYSHN
VVIMNLNNLN		LTQVQQRNLI		TNLQRSVDDT		SQAIQRIKND		FQNLQQVFLQ
AKKDTDWLKE		KVQSLQTLAA		NNSALAKANN		DTLEDMNSQL		NSFTGQMENI
TTISQANEQN		LKDLQDLHKD		AENRTAIKFN		QLEERFQLFE		TDIVNIISNI
SYTAHHLRTL		TSNLNEVRTT		CTDTLTKHTD		DLTSLNNTLA		NIRLDSVSLR
MQQDLMRSRL		DTEVANLSVI		MEEMKLVDSK		HGQLIKNFTI		LQGPPGPRGP
RGDRGSQGPP		GPTGNKGQKG		EKGEPGPPGP		AGERGPIGPA		GPPGERGGKG
SKGSQGPKGS		RGSPGKPGPQ		GSSGDPGPPG		PPGKEGLPGP		QGPPGFQGLQ
GTVGEPGVPG		PRGLPGLPGV		PGMPGPKGPP		GPPGPSGAVV		PLALQNEPTP
APEDNGCPPH		WKNFTDKCYY		FSVEKEIFED		AKLFCEDKSS		HLVFINTREE
QQWIKKQMVG		RESHWIGLTD		SERENEWKWL		DGTSPDYKNW		KAGQPDNWGH
GHGPGEDCAG		LIYAGQWNDF		QCEDVNNFIC		EKDRETVLSS		AL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

• Nakamura K., Funakoshi H., Miyamoto K., Tokunaga F., Nakamura T. (2001). Molecular cloning and functional characterization of a human scavenger receptor with C-type lectin (SRCL), a novel member of a scavenger receptor family. Biochem. Biophys. Res. Commun. 280: 1028—1035. PMID 11162630 DOI:10.1006/bbrc.2000.4210
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Coombs P.J., Graham S.A., Drickamer K., Taylor M.E. (2005). Selective binding of the scavenger receptor C-type lectin to Lewis X trisaccharide and related glycan ligands. J. Biol. Chem. 280: 22993—22999. PMID 15845541 DOI:10.1074/jbc.M504197200
• Feinberg H., Taylor M.E., Weis W.I. (2007). Scavenger receptor C-type lectin binds to the leukocyte cell surface glycan Lewis X by a novel mechanism. J. Biol. Chem. 282: 17250—17258. PMID 17420244 DOI:10.1074/jbc.M701624200

Див. також

• Хромосома 18