CTSL

CTSL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CJL, 1CS8, 1ICF, 1MHW, 2NQD, 2VHS, 2XU1, 2XU3, 2XU4, 2XU5, 2YJ2, 2YJ8, 2YJ9, 2YJB, 2YJC, 3BC3, 3H89, 3H8B, 3H8C, 3HHA, 3HWN, 3IV2, 3K24, 3KSE, 3OF8, 3OF9, 4AXL, 4AXM, 5F02, 5I4H
Ідентифікатори
Символи	CTSL, CATL, CTSL1, MEP, cathepsin L
Зовнішні ІД	OMIM: 116880 HomoloGene: 129366 GeneCards: CTSL
Онтологія гена Молекулярна функція • fibronectin binding • cysteine-type peptidase activity • collagen binding • GO:0031493 histone binding • serpin family protein binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • proteoglycan binding • serine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • extracellular region • endolysosome lumen • lysosomal lumen • лізосома • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix • multivesicular body • клітинна мембрана Біологічний процес • macrophage apoptotic process • antigen processing and presentation • адаптивна імунна відповідь • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • extracellular matrix disassembly • протеоліз • toll-like receptor signaling pathway • cellular response to thyroid hormone stimulus • collagen catabolic process • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • regulation of keratinocyte differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1514	321453
Ensembl	ENSG00000135047	ENSDARG00000007836
UniProt	P07711 Q9HBQ7	Q6NYR5
RefSeq (мРНК)	NM_001257971 NM_001257972 NM_001257973 NM_001912 NM_145918 NM_001382757 NM_001382758 NM_001382766 NM_001382767 NM_001382768	NM_212584
RefSeq (білок)	NP_001244900 NP_001244901 NP_001244902 NP_001903 NP_666023 NP_001369686 NP_001369687 NP_001369695 NP_001369696 NP_001369697 NP_001244902.1	NP_997749
Локус (UCSC)	Хр. 9: 87.72 – 87.73 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTSL (англ. Cathepsin L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 333 амінокислот, а молекулярна маса — 37 564.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNPTLILAAF		CLGIASATLT		FDHSLEAQWT		KWKAMHNRLY		GMNEEGWRRA
VWEKNMKMIE		LHNQEYREGK		HSFTMAMNAF		GDMTSEEFRQ		VMNGFQNRKP
RKGKVFQEPL		FYEAPRSVDW		REKGYVTPVK		NQGQCGSCWA		FSATGALEGQ
MFRKTGRLIS		LSEQNLVDCS		GPQGNEGCNG		GLMDYAFQYV		QDNGGLDSEE
SYPYEATEES		CKYNPKYSVA		NDTGFVDIPK		QEKALMKAVA		TVGPISVAID
AGHESFLFYK		EGIYFEPDCS		SEDMDHGVLV		VGYGFESTES		DNNKYWLVKN
SWGEEWGMGG		YVKMAKDRRN		HCGIASAASY		PTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

• Gal S., Gottesman M.M. (1988). Isolation and sequence of a cDNA for human pro-(cathepsin L). Biochem. J. 253: 303—306. PMID 3421948 DOI:10.1042/bj2530303
• Joseph L.J., Chang L.C., Stamenkovich D., Sukhatme V.P. (1988). Complete nucleotide and deduced amino acid sequences of human and murine preprocathepsin L. An abundant transcript induced by transformation of fibroblasts. J. Clin. Invest. 81: 1621—1629. PMID 2835398 DOI:10.1172/JCI113497
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ritonja A., Popovic T., Kotnik M., Machleidt W., Turk V. (1988). Amino acid sequences of the human kidney cathepsins H and L. FEBS Lett. 228: 341—345. PMID 3342889 DOI:10.1016/0014-5793(88)80028-0
• Joseph L.J., Lapid S., Sukhatme V.P. (1987). The major ras induced protein in NIH3T3 cells is cathepsin L. Nucleic Acids Res. 15: 3186—3186. PMID 3550705 DOI:10.1093/nar/15.7.3186
• Mason R.W., Walker J.E., Northrop F.D. (1986). The N-terminal amino acid sequences of the heavy and light chains of human cathepsin L. Relationship to a cDNA clone for a major cysteine proteinase from a mouse macrophage cell line. Biochem. J. 240: 373—377. PMID 3545185 DOI:10.1042/bj2400373

Див. також

• Хромосома 9