CTSV

CTSV
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FH0, 3H6S, 3KFQ
Ідентифікатори
Символи	CTSV, cathepsin V, CATL2, CTSL2, CTSU
Зовнішні ІД	OMIM: 603308 MGI: 88564 HomoloGene: 76699 GeneCards: CTSV
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • пептидний зв'язок • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • aminopeptidase activity • hydrolase activity • serine-type endopeptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type carboxypeptidase activity • GO:0031493 histone binding • kininogen binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • перикаріон • apical part of cell • secretory granule • extracellular region • Мікроворсинки • вакуоля • lysosomal lumen • neuron projection • лізосома • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • клітинне ядро • ядерце • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • male gonad development • GO:1904578 response to organic cyclic compound • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • cellular response to starvation • extracellular matrix disassembly • response to glucocorticoid • response to glucose • Sertoli cell differentiation • response to gonadotropin • протеоліз • cell communication • decidualization • Сперматогенез • multicellular organism aging • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • nerve development • autophagic cell death • response to odorant • regulation of keratinocyte differentiation • negative regulation of keratinocyte proliferation • protein processing • protein autoprocessing • hair follicle morphogenesis • regulation of actin cytoskeleton reorganization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1515	13039
Ensembl	ENSG00000136943	ENSMUSG00000021477
UniProt	O60911	P06797
RefSeq (мРНК)	NM_001333 NM_001201575	NM_009984
RefSeq (білок)	NP_001188504 NP_001324	NP_034114
Локус (UCSC)	Хр. 9: 97.03 – 97.16 Mb	Хр. 13: 64.51 – 64.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTSV (англ. Cathepsin V) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 334 амінокислот, а молекулярна маса — 37 329.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNLSLVLAAF		CLGIASAVPK		FDQNLDTKWY		QWKATHRRLY		GANEEGWRRA
VWEKNMKMIE		LHNGEYSQGK		HGFTMAMNAF		GDMTNEEFRQ		MMGCFRNQKF
RKGKVFREPL		FLDLPKSVDW		RKKGYVTPVK		NQKQCGSCWA		FSATGALEGQ
MFRKTGKLVS		LSEQNLVDCS		RPQGNQGCNG		GFMARAFQYV		KENGGLDSEE
SYPYVAVDEI		CKYRPENSVA		NDTGFTVVAP		GKEKALMKAV		ATVGPISVAM
DAGHSSFQFY		KSGIYFEPDC		SSKNLDHGVL		VVGYGFEGAN		SNNSKYWLVK
NSWGPEWGSN		GYVKIAKDKN		NHCGIATAAS		YPNV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Локалізований у лізосомі.

Література

• Broemme D., Li Z., Barnes M., Mehler E. (1999). Human cathepsin V functional expression, tissue distribution, electrostatic surface potential, enzymatic characterization, and chromosomal localization. Biochemistry. 38: 2377—2385. PMID 10029531 DOI:10.1021/bi982175f
• Itoh R., Kawamoto S., Adachi W., Kinoshita S., Okubo K. (1999). Genomic organization and chromosomal localization of the human cathepsin L2 gene. DNA Res. 6: 137—140. PMID 10382972 DOI:10.1093/dnares/6.2.137
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Niwa Y., Suzuki T., Dohmae N., Umezawa K., Simizu S. (2012). Determination of cathepsin V activity and intracellular trafficking by N-glycosylation. FEBS Lett. 586: 3601—3607. PMID 22967898 DOI:10.1016/j.febslet.2012.08.001

Див. також

• Хромосома 9