DFFA

DFFA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1IBX, 1IYR, 1KOY
Ідентифікатори
Символи	DFFA, DFF-45, DFF1, ICAD, DNA fragmentation factor subunit alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 601882 MGI: 1196227 HomoloGene: 3240 GeneCards: DFFA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • protein folding chaperone activity • deoxyribonuclease inhibitor activity Клітинна компонента • гіалоплазма • lipid droplet • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • positive regulation of apoptotic process • negative regulation of execution phase of apoptosis • negative regulation of apoptotic DNA fragmentation • apoptotic DNA fragmentation • thymocyte apoptotic process • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of deoxyribonuclease activity • chaperone-mediated protein folding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1676	13347
Ensembl	ENSG00000160049	ENSMUSG00000028974
UniProt	O00273	O54786
RefSeq (мРНК)	NM_213566 NM_004401	NM_001025296 NM_010044
RefSeq (білок)	NP_004392 NP_998731 NP_998731.1	NP_001020467 NP_034174
Локус (UCSC)	Хр. 1: 10.46 – 10.47 Mb	Хр. 4: 149.19 – 149.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DFFA (англ. DNA fragmentation factor subunit alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 331 амінокислот, а молекулярна маса — 36 522.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEVTGDAGVP		ESGEIRTLKP		CLLRRNYSRE		QHGVAASCLE		DLRSKACDIL
AIDKSLTPVT		LVLAEDGTIV		DDDDYFLCLP		SNTKFVALAS		NEKWAYNNSD
GGTAWISQES		FDVDETDSGA		GLKWKNVARQ		LKEDLSSIIL		LSEEDLQMLV
DAPCSDLAQE		LRQSCATVQR		LQHTLQQVLD		QREEVRQSKQ		LLQLYLQALE
KEGSLLSKQE		ESKAAFGEEV		DAVDTGISRE		TSSDVALASH		ILTALREKQA
PELSLSSQDL		ELVTKEDPKA		LAVALNWDIK		KTETVQEACE		RELALRLQQT
QSLHSLRSIS		ASKASPPGDL		QNPKRARQDP		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, ацетиляція. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Liu X., Zou H., Slaughter C., Wang X. (1997). DFF, a heterodimeric protein that functions downstream of caspase-3 to trigger DNA fragmentation during apoptosis. Cell. 89: 175—184. PMID 9108473 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80197-X
• Oh J.J., Grosshans D.R., Wong S.G., Slamon D.J. (1999). Identification of differentially expressed genes associated with HER-2/neu overexpression in human breast cancer cells. Nucleic Acids Res. 27: 4008—4017. PMID 10497265 DOI:10.1093/nar/27.20.4008
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Zhou P., Lugovskoy A.A., McCarty J.S., Li P., Wagner G. (2001). Solution structure of DFF40 and DFF45 N-terminal domain complex and mutual chaperone activity of DFF40 and DFF45. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 6051—6055. PMID 11371636 DOI:10.1073/pnas.111145098

Див. також

• Хромосома 1