DNAJC13

DNAJC13
Ідентифікатори
Символи	DNAJC13, RME8, PARK21, DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13
Зовнішні ІД	OMIM: 614334 MGI: 2676368 HomoloGene: 13574 GeneCards: DNAJC13
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • lysosomal membrane • ендосома • WASH complex • early endosome membrane • endosome membrane • екзосома • early endosome • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • гіалоплазма • клітинна мембрана • secretory granule membrane • azurophil granule membrane Біологічний процес • protein transport • regulation of early endosome to late endosome transport • regulation of early endosome to recycling endosome transport • osteoblast differentiation • endosome organization • neutrophil degranulation • рецептор-опосередкований ендоцитоз • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23317	235567
Ensembl	ENSG00000138246	ENSMUSG00000032560
UniProt	O75165	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_015268 NM_001329126 NM_173823	NM_001163026 NM_001359740
RefSeq (білок)	NP_001316055 NP_056083	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 3: 132.42 – 132.54 Mb	Хр. 9: 104.03 – 104.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNAJC13 (англ. DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 243 амінокислот, а молекулярна маса — 254 415.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNIIRENKDL		ACFYTTKHSW		RGKYKRVFSV		GTHAITTYNP		NTLEVTNQWP
YGDICSISPV		GKGQGTEFNL		TFRKGSGKKS		ETLKFSTEHR		TELLTEALRF
RTDFSEGKIT		GRRYNCYKHH		WSDSRKPVIL		EVTPGGFDQI		NPATNRVLCS
YDYRNIEGFV		DLSDYQGGFC		ILYGGFSRLH		LFASEQREEI		IKSAIDHAGN
YIGISLRIRK		EPLEFEQYLN		LRFGKYSTDE		SITSLAEFVV		QKISPRHSEP
VKRVLALTET		CLVERDPATY		NIATLKPLGE		VFALVCDSEN		PQLFTIEFIK
GQVRKYSSTE		RDSLLASLLD		GVRASGNRDV		CVKMTPTHKG		QRWGLLSMPV
DEEVESLHLR		FLATPPNGNF		ADAVFRFNAN		ISYSGVLHAV		TQDGLFSENK
EKLINNAITA		LLSQEGDVVA		SNAELESQFQ		AVRRLVASKA		GFLAFTQLPK
FRERLGVKVV		KALKRSNNGI		IHAAVDMLCA		LMCPMHDDYD		LRQEQLNKAS
LLSSKKFLEN		LLEKFNSHVD		HGTGALVISS		LLDFLTFALC		APYSETTEGQ
QFDMLLEMVA		SNGRTLFKLF		QHPSMAIIKG		AGLVMKAIIE		EGDKEIATKM
QELALSEGAL		PRHLHTAMFT		ISSDQRMLTN		RQLSRHLVGL		WTADNATATN
LLKRILPPGL		LAYLESSDLV		PEKDADRMHV		RDNVKIAMDQ		YGKFNKVPEW
QRLAGKAAKE		VEKFAKEKVD		LVLMHWRDRM		GIAQKENINQ		KPVVLRKRRQ
RIKIEANWDL		FYYRFGQDHA		RSNLIWNFKT		REELKDTLES		EMRAFNIDRE
LGSANVISWN		HHEFEVKYEC		LAEEIKIGDY		YLRLLLEEDE		NEESGSIKRS
YEFFNELYHR		FLLTPKVNMK		CLCLQALAIV		YGRCHEEIGP		FTDTRYIIGM
LERCTDKLER		DRLILFLNKL		ILNKKNVKDL		MDSNGIRILV		DLLTLAHLHV
SRATVPLQSN		VIEAAPDMKR		ESEKEWYFGN		ADKERSGPYG		FHEMQELWTK
GMLNAKTRCW		AQGMDGWRPL		QSIPQLKWCL		LASGQAVLNE		TDLATLILNM
LITMCGYFPS		RDQDNAIIRP		LPKVKRLLSD		STCLPHIIQL		LLTFDPILVE
KVAILLYHIM		QDNPQLPRLY		LSGVFFFIMM		YTGSNVLPVA		RFLKYTHTKQ
AFKSEETKGQ		DIFQRSILGH		ILPEAMVCYL		ENYEPEKFSE		IFLGEFDTPE
AIWSSEMRRL		MIEKIAAHLA		DFTPRLQSNT		RALYQYCPIP		IINYPQLENE
LFCNIYYLKQ		LCDTLRFPDW		PIKDPVKLLK		DTLDAWKKEV		EKKPPMMSID
DAYEVLNLPQ		GQGPHDESKI		RKAYFRLAQK		YHPDKNPEGR		DMFEKVNKAY
EFLCTKSAKI		VDGPDPENII		LILKTQSILF		NRHKEDLQPY		KYAGYPMLIR
TITMETSDDL		LFSKESPLLP		AATELAFHTV		NCSALNAEEL		RRENGLEVLQ
EAFSRCVAVL		TRASKPSDMS		VQVCGYISKC		YSVAAQFEEC		REKITEMPSI
IKDLCRVLYF		GKSIPRVAAL		GVECVSSFAV		DFWLQTHLFQ		AGILWYLLGF
LFNYDYTLEE		SGIQKSEETN		QQEVANSLAK		LSVHALSRLG		GYLAEEQATP
ENPTIRKSLA		GMLTPYVARK		LAVASVTEIL		KMLNSNTESP		YLIWNNSTRA
ELLEFLESQQ		ENMIKKGDCD		KTYGSEFVYS		DHAKELIVGE		IFVRVYNEVP
TFQLEVPKAF		AASLLDYIGS		QAQYLHTFMA		ITHAAKVESE		QHGDRLPRVE
MALEALRNVI		KYNPGSESEC		IGHFKLIFSL		LRVHGAGQVQ		QLALEVVNIV
TSNQDCVNNI		AESMVLSSLL		ALLHSLPSSR		QLVLETLYAL		TSSTKIIKEA
MAKGALIYLL		DMFCNSTHPQ		VRAQTAELFA		KMTADKLIGP		KVRITLMKFL
PSVFMDAMRD		NPEAAVHIFE		GTHENPELIW		NDNSRDKVST		TVREMMLEHF
KNQQDNPEAN		WKLPEDFAVV		FGEAEGELAV		GGVFLRIFIA		QPAWVLRKPR
EFLIALLEKL		TELLEKNNPH		GETLETLTMA		TVCLFSAQPQ		LADQVPPLGH
LPKVIQAMNH		RNNAIPKSAI		RVIHALSENE		LCVRAMASLE		TIGPLMNGMK
KRADTVGLAC		EAINRMFQKE		QSELVAQALK		ADLVPYLLKL		LEGIGLENLD
SPAATKAQIV		KALKAMTRSL		QYGEQVNEIL		CRSSVWSAFK		DQKHDLFISE
SQTAGYLTGP		GVAGYLTAGT		STSVMSNLPP		PVDHEAGDLG		YQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до шаперонів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• Girard M., Poupon V., Blondeau F., McPherson P.S. (2005). The DnaJ-domain protein RME-8 functions in endosomal trafficking. J. Biol. Chem. 280: 40135—40143. PMID 16179350 DOI:10.1074/jbc.M505036200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Girard M., McPherson P.S. (2008). RME-8 regulates trafficking of the epidermal growth factor receptor. FEBS Lett. 582: 961—966. PMID 18307993 DOI:10.1016/j.febslet.2008.02.042
• Freeman C.L., Hesketh G., Seaman M.N. (2014). RME-8 coordinates the activity of the WASH complex with the function of the retromer SNX dimer to control endosomal tubulation. J. Cell Sci. 127: 2053—2070. PMID 24643499 DOI:10.1242/jcs.144659

Див. також

• Хромосома 3