DNMBP

DNMBP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UG1, 1UHC, 4CC2, 4CC3, 4CC4, 4CC7, 4GLM
Ідентифікатори
Символи	DNMBP, ARHGEF36, TUBA, dynamin binding protein, CTRCT48
Зовнішні ІД	OMIM: 611282 MGI: 1917352 HomoloGene: 9061 GeneCards: DNMBP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • міжклітинні контакти • Golgi stack • комплекс Ґольджі • синапс • цитоскелет • cell-cell junction • presynapse Біологічний процес • regulation of Rho protein signal transduction • GO:0007243 intracellular signal transduction • small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0010260 старіння людини • довготривала пам'ять • regulation of cell shape Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23268	71972
Ensembl	ENSG00000107554	ENSMUSG00000025195
UniProt	Q6XZF7	Q6TXD4
RefSeq (мРНК)	NM_015221 NM_001318326 NM_001318327	NM_028029 NM_001306088
RefSeq (білок)	NP_001305255 NP_001305256 NP_056036	NP_001293017 NP_082305 NP_001390219 NP_001390220 NP_001390221 NP_001390222 NP_001390223 NP_001390224 NP_001390225 NP_001390226
Локус (UCSC)	Хр. 10: 99.88 – 100.01 Mb	Хр. 19: 43.84 – 43.93 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNMBP (англ. Dynamin binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 577 амінокислот, а молекулярна маса — 177 347.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAGSVVRAI		FDFCPSVSEE		LPLFVGDIIE		VLAVVDEFWL		LGKKEDVTGQ
FPSSFVEIVT		IPSLKEGERL		FVCICEFTSQ		ELDNLPLHRG		DLVILDGIPT
AGWLQGRSCW		GARGFFPSSC		VRELCLSSQS		RQWHSQSALF		QIPEYSMGQA
RALMGLSAQL		DEELDFREGD		VITIIGVPEP		GWFEGELEGR		RGIFPEGFVE
LLGPLRTVDE		SVSSGNQDDC		IVNGEVDTPV		GEEEIGPDED		EEEPGTYGVA
LYRFQALEPN		ELDFEVGDKI		RILATLEDGW		LEGSLKGRTG		IFPYRFVKLC
PDTRVEETMA		LPQEGSLARI		PETSLDCLEN		TLGVEEQRHE		TSDHEAEEPD
CIISEAPTSP		LGHLTSEYDT		DRNSYQDEDT		AGGPPRSPGV		EWEMPLATDS
PTSDPTEVVN		GISSQPQVPF		HPNLQKSQYY		STVGGSHPHS		EQYPDLLPLE
ARTRDYASLP		PKRMYSQLKT		LQKPVLPLYR		GSSVSASRVV		KPRQSSPQLH
NLASYTKKHH		TSSVYSISER		LEMKPGPQAQ		GLVMEAATHS		QGDGSTDLDS
KLTQQLIEFE		KSLAGPGTEP		DKILRHFSIM		DFNSEKDIVR		GSSKLITEQE
LPERRKALRP		PPPRPCTPVS		TSPHLLVDQN		LKPAPPLVVR		PSRPAPLPPS
AQQRTNAVSP		KLLSRHRPTC		ETLEKEGPGH		MGRSLDQTSP		CPLVLVRIEE
MERDLDMYSR		AQEELNLMLE		EKQDESSRAE		TLEDLKFCES		NIESLNMELQ
QLREMTLLSS		QSSSLVAPSG		SVSAENPEQR		MLEKRAKVIE		ELLQTERDYI
RDLEMCIERI		MVPMQQAQVP		NIDFEGLFGN		MQMVIKVSKQ		LLAALEISDA
VGPVFLGHRD		ELEGTYKIYC		QNHDEAIALL		EIYEKDEKIQ		KHLQDSLADL
KSLYNEWGCT		NYINLGSFLI		KPVQRVMRYP		LLLMELLNST		PESHPDKVPL
TNAVLAVKEI		NVNINEYKRR		KDLVLKYRKG		DEDSLMEKIS		KLNIHSIIKK
SNRVSSHLKH		LTGFAPQIKD		EVFEETEKNF		RMQERLIKSF		IRDLSLYLQH
IRESACVKVV		AAVSMWDVCM		ERGHRDLEQF		ERVHRYISDQ		LFTNFKERTE
RLVISPLNQL		LSMFTGPHKL		VQKRFDKLLD		FYNCTERAEK		LKDKKTLEEL
QSARNNYEAL		NAQLLDELPK		FHQYAQGLFT		NCVHGYAEAH		CDFVHQALEQ
LKPLLSLLKV		AGREGNLIAI		FHEEHSRVLQ		QLQVFTFFPE		SLPATKKPFE
RKTIDRQSAR		KPLLGLPSYM		LQSEELRASL		LARYPPEKLF		QAERNFNAAQ
DLDVSLLEGD		LVGVIKKKDP		MGSQNRWLID		NGVTKGFVYS		SFLKPYNPRR
SHSDASVGSH		SSTESEHGSS		SPRFPRQNSG		STLTFNPSSM		AVSFTSGSCQ
KQPQDASPPP		KECDQGTLSA		SLNPSNSESS		PSRCPSDPDS		TSQPRSGDSA
DVARDVKQPT		ATPRSYRNFR		HPEIVGYSVP		GRNGQSQDLV		KGCARTAQAP
EDRSTEPDGS		EAEGNQVYFA		VYTFKARNPN		ELSVSANQKL		KILEFKDVTG
NTEWWLAEVN		GKKGYVPSNY		IRKTEYT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, апараті гольджі, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53

Див. також

• Хромосома 10