DOCK9

DOCK9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WG7, 2WM9, 2WMN, 2WMO
Ідентифікатори
Символи	DOCK9, ZIZ1, ZIZIMIN1, Dock9, dedicator of cytokinesis 9
Зовнішні ІД	OMIM: 607325 MGI: 106321 HomoloGene: 41026 GeneCards: DOCK9
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • cadherin binding Клітинна компонента • гіалоплазма • система ендомембран • мембрана Біологічний процес • зсідання крові • small GTPase mediated signal transduction • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23348	105445
Ensembl	ENSG00000088387	ENSMUSG00000025558
UniProt	Q9BZ29	Q8BIK4
RefSeq (мРНК)	NM_001130048 NM_001130049 NM_001130050 NM_015296 NM_001318849 NM_001366676 NM_001366677 NM_001366678 NM_001366679 NM_001366680 NM_001366681 NM_001366682 NM_001366683 NM_001366684	NM_001081039 NM_001128307 NM_001128308 NM_134074 NM_001347596
RefSeq (білок)	NP_001123520 NP_001123521 NP_001123522 NP_001305778 NP_056111 NP_001353605 NP_001353606 NP_001353607 NP_001353608 NP_001353609 NP_001353610 NP_001353611 NP_001353612 NP_001353613	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 13: 98.79 – 99.09 Mb	Хр. 14: 121.78 – 122.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DOCK9 (англ. Dedicator of cytokinesis 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 069 амінокислот, а молекулярна маса — 236 446.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQPPLLPAS		AETRKFTRAL		SKPGTAAELR		QSVSEVVRGS		VLLAKPKLIE
PLDYENVIVQ		KKTQILNDCL		REMLLFPYDD		FQTAILRRQG		RYICSTVPAK
AEEEAQSLFV		TECIKTYNSD		WHLVNYKYED		YSGEFRQLPN		KVVKLDKLPV
HVYEVDEEVD		KDEDAASLGS		QKGGITKHGW		LYKGNMNSAI		SVTMRSFKRR
FFHLIQLGDG		SYNLNFYKDE		KISKEPKGSI		FLDSCMGVVQ		NNKVRRFAFE
LKMQDKSSYL		LAADSEVEME		EWITILNKIL		QLNFEAAMQE		KRNGDSHEDD
EQSKLEGSGS		GLDSYLPELA		KSAREAEIKL		KSESRVKLFY		LDPDAQKLDF
SSAEPEVKSF		EEKFGKRILV		KCNDLSFNLQ		CCVAENEEGP		TTNVEPFFVT
LSLFDIKYNR		KISADFHVDL		NHFSVRQMLA		TTSPALMNGS		GQSPSVLKGI
LHEAAMQYPK		QGIFSVTCPH		PDIFLVARIE		KVLQGSITHC		AEPYMKSSDS
SKVAQKVLKN		AKQACQRLGQ		YRMPFAWAAR		TLFKDASGNL		DKNARFSAIY
RQDSNKLSND		DMLKLLADFR		KPEKMAKLPV		ILGNLDITID		NVSSDFPNYV
NSSYIPTKQF		ETCSKTPITF		EVEEFVPCIP		KHTQPYTIYT		NHLYVYPKYL
KYDSQKSFAK		ARNIAICIEF		KDSDEEDSQP		LKCIYGRPGG		PVFTRSAFAA
VLHHHQNPEF		YDEIKIELPT		QLHEKHHLLL		TFFHVSCDNS		SKGSTKKRDV
VETQVGYSWL		PLLKDGRVVT		SEQHIPVSAN		LPSGYLGYQE		LGMGRHYGPE
IKWVDGGKPL		LKISTHLVST		VYTQDQHLHN		FFQYCQKTES		GAQALGNELV
KYLKSLHAME		GHVMIAFLPT		ILNQLFRVLT		RATQEEVAVN		VTRVIIHVVA
QCHEEGLESH		LRSYVKYAYK		AEPYVASEYK		TVHEELTKSM		TTILKPSADF
LTSNKLLKYS		WFFFDVLIKS		MAQHLIENSK		VKLLRNQRFP		ASYHHAVETV
VNMLMPHITQ		KFRDNPEASK		NANHSLAVFI		KRCFTFMDRG		FVFKQINNYI
SCFAPGDPKT		LFEYKFEFLR		VVCNHEHYIP		LNLPMPFGKG		RIQRYQDLQL
DYSLTDEFCR		NHFLVGLLLR		EVGTALQEFR		EVRLIAISVL		KNLLIKHSFD
DRYASRSHQA		RIATLYLPLF		GLLIENVQRI		NVRDVSPFPV		NAGMTVKDES
LALPAVNPLV		TPQKGSTLDN		SLHKDLLGAI		SGIASPYTTS		TPNINSVRNA
DSRGSLISTD		SGNSLPERNS		EKSNSLDKHQ		QSSTLGNSVV		RCDKLDQSEI
KSLLMCFLYI		LKSMSDDALF		TYWNKASTSE		LMDFFTISEV		CLHQFQYMGK
RYIARTGMMH		ARLQQLGSLD		NSLTFNHSYG		HSDADVLHQS		LLEANIATEV
CLTALDTLSL		FTLAFKNQLL		ADHGHNPLMK		KVFDVYLCFL		QKHQSETALK
NVFTALRSLI		YKFPSTFYEG		RADMCAALCY		EILKCCNSKL		SSIRTEASQL
LYFLMRNNFD		YTGKKSFVRT		HLQVIISVSQ		LIADVVGIGG		TRFQQSLSII
NNCANSDRLI		KHTSFSSDVK		DLTKRIRTVL		MATAQMKEHE		NDPEMLVDLQ
YSLAKSYAST		PELRKTWLDS		MARIHVKNGD		LSEAAMCYVH		VTALVAEYLT
RKEAVQWEPP		LLPHSHSACL		RRSRGGVFRQ		GCTAFRVITP		NIDEEASMME
DVGMQDVHFN		EDVLMELLEQ		CADGLWKAER		YELIADIYKL		IIPIYEKRRD
FERLAHLYDT		LHRAYSKVTE		VMHSGRRLLG		TYFRVAFFGQ		AAQYQFTDSE
TDVEGFFEDE		DGKEYIYKEP		KLTPLSEISQ		RLLKLYSDKF		GSENVKMIQD
SGKVNPKDLD		SKYAYIQVTH		VIPFFDEKEL		QERKTEFERS		HNIRRFMFEM
PFTQTGKRQG		GVEEQCKRRT		ILTAIHCFPY		VKKRIPVMYQ		HHTDLNPIEV
AIDEMSKKVA		ELRQLCSSAE		VDMIKLQLKL		QGSVSVQVNA		GPLAYARAFL
DDTNTKRYPD		NKVKLLKEVF		RQFVEACGQA		LAVNERLIKE		DQLEYQEEMK
ANYREMAKEL		SEIMHEQLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Meller N., Irani-Tehrani M., Kiosses W.B., Del Pozo M.A., Schwartz M.A. (2002). Zizimin1, a novel Cdc42 activator, reveals a new GEF domain for Rho proteins. Nat. Cell Biol. 4: 639—647. PMID 12172552 DOI:10.1038/ncb835
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cote J.-F., Vuori K. (2002). Identification of an evolutionarily conserved superfamily of DOCK180-related proteins with guanine nucleotide exchange activity. J. Cell Sci. 115: 4901—4913. PMID 12432077 DOI:10.1242/jcs.00219
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Yang J., Zhang Z., Roe S.M., Marshall C.J., Barford D. (2009). Activation of Rho GTPases by DOCK exchange factors is mediated by a nucleotide sensor. Science. 325: 1398—1402. PMID 19745154 DOI:10.1126/science.1174468

Див. також

• Хромосома 13