EDEM1

EDEM1
Ідентифікатори
Символи	EDEM1, EDEM, ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607673 MGI: 2180139 HomoloGene: 33836 GeneCards: EDEM1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • misfolded protein binding • mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність Клітинна компонента • integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum quality control compartment • Golgi membrane • aggresome Біологічний процес • N-glycan processing • positive regulation of retrograde protein transport, ER to cytosol • trimming of terminal mannose on C branch • IRE1-mediated unfolded protein response • response to unfolded protein • ubiquitin-dependent glycoprotein ERAD pathway • mannose trimming involved in glycoprotein ERAD pathway • ubiquitin-dependent ERAD pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9695	192193
Ensembl	ENSG00000134109	ENSMUSG00000030104
UniProt	Q92611	Q925U4
RefSeq (мРНК)	NM_014674	NM_138677
RefSeq (білок)	NP_055489	NP_619618
Локус (UCSC)	Хр. 3: 5.19 – 5.22 Mb	Хр. 6: 108.81 – 108.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EDEM1 (англ. ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 657 амінокислот, а молекулярна маса — 73 768.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQWRALVLGL		VLLRLGLHGV		LWLVFGLGPS		MGFYQRFPLS		FGFQRLRSPD
GPASPTSGPV		GRPGGVSGPS		WLQPPGTGAA		QSPRKAPRRP		GPGMCGPANW
GYVLGGRGRG		PDEYEKRYSG		AFPPQLRAQM		RDLARGMFVF		GYDNYMAHAF
PQDELNPIHC		RGRGPDRGDP		SNLNINDVLG		NYSLTLVDAL		DTLAIMGNSS
EFQKAVKLVI		NTVSFDKDST		VQVFEATIRV		LGSLLSAHRI		ITDSKQPFGD
MTIKDYDNEL		LYMAHDLAVR		LLPAFENTKT		GIPYPRVNLK		TGVPPDTNNE
TCTAGAGSLL		VEFGILSRLL		GDSTFEWVAR		RAVKALWNLR		SNDTGLLGNV
VNIQTGHWVG		KQSGLGAGLD		SFYEYLLKSY		ILFGEKEDLE		MFNAAYQSIQ
NYLRRGREAC		NEGEGDPPLY		VNVNMFSGQL		MNTWIDSLQA		FFPGLQVLIG
DVEDAICLHA		FYYAIWKRYG		ALPERYNWQL		QAPDVLFYPL		RPELVESTYL
LYQATKNPFY		LHVGMDILQS		LEKYTKVKCG		YATLHHVIDK		STEDRMESFF
LSETCKYLYL		LFDEDNPVHK		SGTRYMFTTE		GHIVSVDEHL		RELPWKEFFS
EEGGQDQGGK		SVHRPKPHEL		KVINSSSNCN		RVPDERRYSL		PLKSIYMRQI
DQMVGLI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як відповідь на порушення конформації білку, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Molinari M., Calanca V., Galli C., Lucca P., Paganetti P. (2003). Role of EDEM in the release of misfolded glycoproteins from the calnexin cycle. Science. 299: 1397—1400. PMID 12610306 DOI:10.1126/science.1079474
• Kosmaoglou M., Kanuga N., Aguila M., Garriga P., Cheetham M.E. (2009). A dual role for EDEM1 in the processing of rod opsin. J. Cell Sci. 122: 4465—4472. PMID 19934218 DOI:10.1242/jcs.055228
• Cormier J.H., Tamura T., Sunryd J.C., Hebert D.N. (2009). EDEM1 recognition and delivery of misfolded proteins to the SEL1L-containing ERAD complex. Mol. Cell. 34: 627—633. PMID 19524542 DOI:10.1016/j.molcel.2009.05.018

Див. також

• Хромосома 3