EDEM2

EDEM2
Ідентифікатори
Символи	EDEM2, C20orf31, C20orf49, bA4204.1, ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610302 MGI: 1915540 HomoloGene: 10075 GeneCards: EDEM2
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase activity • каталітична активність Клітинна компонента • endoplasmic reticulum lumen • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • endoplasmic reticulum quality control compartment Біологічний процес • Відповідь на незгорнуті білки • mannose trimming involved in glycoprotein ERAD pathway • N-glycan processing • positive regulation of retrograde protein transport, ER to cytosol • response to unfolded protein • ubiquitin-dependent glycoprotein ERAD pathway • trimming of terminal mannose on B branch • trimming of terminal mannose on C branch • trimming of first mannose on A branch • trimming of second mannose on A branch Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55741	108687
Ensembl	ENSG00000088298	ENSMUSG00000038312
UniProt	Q9BV94	Q8BJT9
RefSeq (мРНК)	NM_001145025 NM_018217	NM_145537
RefSeq (білок)	NP_001138497 NP_060687	NP_663512
Локус (UCSC)	Хр. 20: 35.12 – 35.15 Mb	Хр. 2: 155.54 – 155.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EDEM2 (англ. ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 578 амінокислот, а молекулярна маса — 64 753.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPFRLLIPLG		LLCALLPQHH		GAPGPDGSAP		DPAHYRERVK		AMFYHAYDSY
LENAFPFDEL		RPLTCDGHDT		WGSFSLTLID		ALDTLLILGN		VSEFQRVVEV
LQDSVDFDID		VNASVFETNI		RVVGGLLSAH		LLSKKAGVEV		EAGWPCSGPL
LRMAEEAARK		LLPAFQTPTG		MPYGTVNLLH		GVNPGETPVT		CTAGIGTFIV
EFATLSSLTG		DPVFEDVARV		ALMRLWESRS		DIGLVGNHID		VLTGKWVAQD
AGIGAGVDSY		FEYLVKGAIL		LQDKKLMAMF		LEYNKAIRNY		TRFDDWYLWV
QMYKGTVSMP		VFQSLEAYWP		GLQSLIGDID		NAMRTFLNYY		TVWKQFGGLP
EFYNIPQGYT		VEKREGYPLR		PELIESAMYL		YRATGDPTLL		ELGRDAVESI
EKISKVECGF		ATIKDLRDHK		LDNRMESFFL		AETVKYLYLL		FDPTNFIHNN
GSTFDAVITP		YGECILGAGG		YIFNTEAHPI		DPAALHCCQR		LKEEQWEVED
LMREFYSLKR		SRSKFQKNTV		SSGPWEPPAR		PGTLFSPENH		DQARERKPAK
QKVPLLSCPS		QPFTSKLALL		GQVFLDSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на порушення конформації білку, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Olivari S., Galli C., Alanen H., Ruddock L., Molinari M. (2005). A novel stress-induced EDEM variant regulating endoplasmic reticulum-associated glycoprotein degradation. J. Biol. Chem. 280: 2424—2428. PMID 15579471 DOI:10.1074/jbc.C400534200

Див. також

• Хромосома 20