EDIL3

EDIL3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4D90
Ідентифікатори
Символи	EDIL3, DEL1, EGF like repeats and discoidin domains 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606018 MGI: 1329025 HomoloGene: 21166 GeneCards: EDIL3
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • integrin binding • зв'язування з іоном металу • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • extracellular vesicle • extracellular region • екзосома • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • multicellular organism development • адгезія клітин • positive regulation of cell-substrate adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10085	13612
Ensembl	ENSG00000164176	ENSMUSG00000034488
UniProt	O43854	O35474
RefSeq (мРНК)	NM_001278642 NM_005711	NM_001037987 NM_010103
RefSeq (білок)	NP_001265571 NP_005702	NP_001033076 NP_034233
Локус (UCSC)	Хр. 5: 83.94 – 84.38 Mb	Хр. 13: 88.97 – 89.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EDIL3 (англ. EGF like repeats and discoidin domains 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 53 765.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRSVAVWLL		VGLSLGVPQF		GKGDICDPNP		CENGGICLPG		LADGSFSCEC
PDGFTDPNCS		SVVEVASDEE		EPTSAGPCTP		NPCHNGGTCE		ISEAYRGDTF
IGYVCKCPRG		FNGIHCQHNI		NECEVEPCKN		GGICTDLVAN		YSCECPGEFM
GRNCQYKCSG		PLGIEGGIIS		NQQITASSTH		RALFGLQKWY		PYYARLNKKG
LINAWTAAEN		DRWPWIQINL		QRKMRVTGVI		TQGAKRIGSP		EYIKSYKIAY
SNDGKTWAMY		KVKGTNEDMV		FRGNIDNNTP		YANSFTPPIK		AQYVRLYPQV
CRRHCTLRME		LLGCELSGCS		EPLGMKSGHI		QDYQITASSI		FRTLNMDMFT
WEPRKARLDK		QGKVNAWTSG		HNDQSQWLQV		DLLVPTKVTG		IITQGAKDFG
HVQFVGSYKL		AYSNDGEHWT		VYQDEKQRKD		KVFQGNFDND		THRKNVIDPP
IYARHIRILP		WSWYGRITLR		SELLGCTEEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5