EFHD2

EFHD2
Ідентифікатори
Символи	EFHD2, SWS1, EF-hand domain family member D2
Зовнішні ІД	OMIM: 616450 MGI: 106504 HomoloGene: 32580 GeneCards: EFHD2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding • cadherin binding Клітинна компонента • мембрана • membrane raft Біологічний процес • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79180	27984
Ensembl	ENSG00000142634	ENSMUSG00000040659
UniProt	Q96C19	Q9D8Y0 Q8C845
RefSeq (мРНК)	NM_024329	NM_025994
RefSeq (білок)	NP_077305	NP_080270
Локус (UCSC)	Хр. 1: 15.41 – 15.43 Mb	Хр. 4: 141.59 – 141.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EFHD2 (англ. EF-hand domain family member D2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 26 697.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATDELATKL		SRRLQMEGEG		GGETPEQPGL		NGAAAAAAGA		PDEAAEALGS
ADCELSAKLL		RRADLNQGIG		EPQSPSRRVF		NPYTEFKEFS		RKQIKDMEKM
FKQYDAGRDG		FIDLMELKLM		MEKLGAPQTH		LGLKNMIKEV		DEDFDSKLSF
REFLLIFRKA		AAGELQEDSG		LCVLARLSEI		DVSSEGVKGA		KSFFEAKVQA
INVSSRFEEE		IKAEQEERKK		QAEEMKQRKA		AFKELQSTFK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Checinska A., Giaccone G., Rodriguez J.A., Kruyt F.A.E., Jimenez C.R. (2009). Comparative proteomics analysis of caspase-9-protein complexes in untreated and cytochrome c/dATP stimulated lysates of NSCLC cells. J. Proteomics. 72: 575—585. PMID 19118655 DOI:10.1016/j.jprot.2008.11.016

Див. також

• Хромосома 1