EMILIN1

EMILIN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KA3, 2OII
Ідентифікатори
Символи	EMILIN1, EMI, EMILIN, gp115, elastin microfibril interfacer 1
Зовнішні ІД	OMIM: 130660 MGI: 1926189 HomoloGene: 5117 GeneCards: EMILIN1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellular matrix constituent conferring elasticity • identical protein binding • integrin binding involved in cell-matrix adhesion • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • колаген • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • integrin alpha4-beta1 complex • EMILIN complex • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • адгезія клітин • cell-matrix adhesion • cell migration • protein homotrimerization • aortic valve morphogenesis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • positive regulation of cell-substrate adhesion • negative regulation of angiogenesis • extracellular matrix organization • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • negative regulation of vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of collagen biosynthetic process • elastic fiber assembly • negative regulation of cell activation • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of extracellular matrix assembly • negative regulation of collagen fibril organization • negative regulation of macrophage migration Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11117	100952
Ensembl	ENSG00000138080	ENSMUSG00000029163
UniProt	Q9Y6C2	Q99K41
RefSeq (мРНК)	NM_007046	NM_133918
RefSeq (білок)	NP_008977	NP_598679
Локус (UCSC)	Хр. 2: 27.08 – 27.09 Mb	Хр. 5: 31.07 – 31.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EMILIN1 (англ. Elastin microfibril interfacer 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 016 амінокислот, а молекулярна маса — 106 667.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPRTLWSCY		LCCLLTAAAG		AASYPPRGFS		LYTGSSGALS		PGGPQAQIAP
RPASRHRNWC		AYVVTRTVSC		VLEDGVETYV		KYQPCAWGQP		QCPQSIMYRR
FLRPRYRVAY		KTVTDMEWRC		CQGYGGDDCA		ESPAPALGPA		SSTPRPLAQP
ARPNLSGSSA		GSPLSGLGGE		GPGESEKVQQ		LEEQVQSLTK		ELQGLRGVLQ
GLSGRLAEDV		QRAVETAFNG		RQQPADAAAR		PGVHETLNEI		QHQLQLLDTR
VSTHDQELGH		LNNHHGGSSS		SGGSRAPAPA		SAPPGPSEEL		LRQLEQRLQE
SCSVCLAGLD		GFRRQQQEDR		ERLRAMEKLL		ASVEERQRHL		AGLAVGRRPP
QECCSPELGR		RLAELERRLD		VVAGSVTVLS		GRRGTELGGA		AGQGGHPPGY
TSLASRLSRL		EDRFNSTLGP		SEEQEESWPG		APGGLSHWLP		AARGRLEQLG
GLLANVSGEL		GGRLDLLEEQ		VAGAMQACGQ		LCSGAPGEQD		SQVSEILSAL
ERRVLDSEGQ		LRLVGSGLHT		VEAAGEARQA		TLEGLQEVVG		RLQDRVDAQD
ETAAEFTLRL		NLTAARLGQL		EGLLQAHGDE		GCGACGGVQE		ELGRLRDGVE
RCSCPLLPPR		GPGAGPGVGG		PSRGPLDGFS		VFGGSSGSAL		QALQGELSEV
ILSFSSLNDS		LNELQTTVEG		QGADLADLGA		TKDRIISEIN		RLQQEATEHA
TESEERFRGL		EEGQAQAGQC		PSLEGRLGRL		EGVCERLDTV		AGGLQGLREG
LSRHVAGLWA		GLRETNTTSQ		MQAALLEKLV		GGQAGLGRRL		GALNSSLQLL
EDRLHQLSLK		DLTGPAGEAG		PPGPPGLQGP		PGPAGPPGSP		GKDGQEGPIG
PPGPQGEQGV		EGAPAAPVPQ		VAFSAALSLP		RSEPGTVPFD		RVLLNDGGYY
DPETGVFTAP		LAGRYLLSAV		LTGHRHEKVE		AVLSRSNQGV		ARVDSGGYEP
EGLENKPVAE		SQPSPGTLGV		FSLILPLQAG		DTVCVDLVMG		QLAHSEEPLT
IFSGALLYGD		PELEHA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200

Див. також

• Хромосома 2