ERVFRD-1

ERVFRD-1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Y4M
Ідентифікатори
Символи	ERVFRD-1, ERVFRDE1, GLLL6191, HERV-FRD, HERV-W/FRD, UNQ6191, envFRD, endogenous retrovirus group FRD member 1, endogenous retrovirus group FRD member 1, envelope
Зовнішні ІД	OMIM: 610524 MGI: 3045308 HomoloGene: 86779 GeneCards: ERVFRD-1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	405754	239167
Ensembl	ENSG00000244476	ENSMUSG00000047977
UniProt	P60508	Q8BI41
RefSeq (мРНК)	NM_207582	NM_173420
RefSeq (білок)	NP_997465	NP_775596
Локус (UCSC)	Хр. 6: 11.1 – 11.11 Mb	Хр. 14: 69.53 – 69.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ERVFRD-1 (англ. Endogenous retrovirus group FRD member 1, envelope) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 538 амінокислот, а молекулярна маса — 59 523.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLLLLVLIL		TPSLAAYRHP		DFPLLEKAQQ		LLQSTGSPYS		TNCWLCTSSS
TETPGTAYPA		SPREWTSIEA		ELHISYRWDP		NLKGLMRPAN		SLLSTVKQDF
PDIRQKPPIF		GPIFTNINLM		GIAPICVMAK		RKNGTNVGTL		PSTVCNVTFT
VDSNQQTYQT		YTHNQFRHQP		RFPKPPNITF		PQGTLLDKSS		RFCQGRPSSC
STRNFWFRPA		DYNQCLQISN		LSSTAEWVLL		DQTRNSLFWE		NKTKGANQSQ
TPCVQVLAGM		TIATSYLGIS		AVSEFFGTSL		TPLFHFHIST		CLKTQGAFYI
CGQSIHQCLP		SNWTGTCTIG		YVTPDIFIAP		GNLSLPIPIY		GNSPLPRVRR
AIHFIPLLAG		LGILAGTGTG		IAGITKASLT		YSQLSKEIAN		NIDTMAKALT
TMQEQIDSLA		AVVLQNRRGL		DMLTAAQGGI		CLALDEKCCF		WVNQSGKVQD
NIRQLLNQAS		SLRERATQGW		LNWEGTWKWF		SWVLPLTGPL		VSLLLLLLFG
PCLLNLITQF		VSSRLQAIKL		QTNLSAGRHP		RNIQESPF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Blaise S., de Parseval N., Benit L., Heidmann T. (2003). Genomewide screening for fusogenic human endogenous retrovirus envelopes identifies syncytin 2, a gene conserved on primate evolution. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 13013—13018. PMID 14557543 DOI:10.1073/pnas.2132646100
• Blaise S., Ruggieri A., Dewannieux M., Cosset F.-L., Heidmann T. (2004). Identification of an envelope protein from the FRD family of human endogenous retroviruses (HERV-FRD) conferring infectivity and functional conservation among simians. J. Virol. 78: 1050—1054. PMID 14694139 DOI:10.1128/JVI.78.2.1050-1054.2004
• de Parseval N., Lazar V., Casella J.-F., Benit L., Heidmann T. (2003). Survey of human genes of retroviral origin: identification and transcriptome of the genes with coding capacity for complete envelope proteins. J. Virol. 77: 10414—10422. PMID 12970426 DOI:10.1128/JVI.77.19.10414-10422.2003
• Sugimoto J., Sugimoto M., Bernstein H., Jinno Y., Schust D. (2013). A novel human endogenous retroviral protein inhibits cell-cell fusion. Sci. Rep. 3: 1462—1462. PMID 23492904 DOI:10.1038/srep01462

Див. також

• Хромосома 6