FAP (ген)

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
FAP
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи FAP, DPPIV, FAPA, SIMP, fibroblast activation protein alpha, FAPalpha
Зовнішні ІД OMIM: 600403 MGI: 109608 HomoloGene: 48282 GeneCards: FAP
шифр КФ 3.4.14.5
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001291807
NM_004460
NM_007986
RefSeq (білок)
NP_001278736
NP_004451
NP_032012
Локус (UCSC) Хр. 2: 162.17 – 162.25 Mb Хр. 2: 62.33 – 62.4 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FAP (англ. Fibroblast activation protein alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 760 амінокислот, а молекулярна маса — 87 713[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKTWVKIVFGVATSAVLALLVMCIVLRPSRVHNSEENTMRALTLKDILNG
TFSYKTFFPNWISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMKSVNA
SNYGLSPDRQFVYLESDYSKLWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPI
QYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPPFQITFNGRENKIFNGIPDWV
YEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYGDEQYPRTINI
PYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVT
DERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGF
FVSTPVFSYDAISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINI
FRVTQDSLFYSSNEFEEYPGRRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQY
YTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGRTDQEIKILEENKELENALKN
IQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQVYGGPCSQSVR
SVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQ
ITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPV
SSWEYYASVYTERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGT
ADDNVHFQNSAQIAKALVNAQVDFQAMWYSDQNHGLSGLSTNHLYTHMTH
FLKQCFSLSD

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, клітинна адгезія, ангіогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Goldstein L.A., Chen W.-T. (2000). Identification of an alternatively spliced seprase mRNA that encodes a novel intracellular isoform. J. Biol. Chem. 275: 2554—2559. PMID 10644713 DOI:10.1074/jbc.275.4.2554
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lee K.N., Jackson K.W., Christiansen V.J., Chung K.H., McKee P.A. (2004). A novel plasma proteinase potentiates alpha2-antiplasmin inhibition of fibrin digestion. Blood. 103: 3783—3788. PMID 14751930 DOI:10.1182/blood-2003-12-4240
  • Aoyama A., Chen W.T. (1990). A 170-kDa membrane-bound protease is associated with the expression of invasiveness by human malignant melanoma cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 8296—8300. PMID 2172980 DOI:10.1073/pnas.87.21.8296
  • Artym V.V., Kindzelskii A.L., Chen W.T., Petty H.R. (2002). Molecular proximity of seprase and the urokinase-type plasminogen activator receptor on malignant melanoma cell membranes: dependence on beta1 integrins and the cytoskeleton. Carcinogenesis. 23: 1593—1601. PMID 12376466 DOI:10.1093/carcin/23.10.1593
  • Wang X.M., Yu D.M., McCaughan G.W., Gorrell M.D. (2005). Fibroblast activation protein increases apoptosis, cell adhesion, and migration by the LX-2 human stellate cell line. Hepatology. 42: 935—945. PMID 16175601 DOI:10.1002/hep.20853

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3590 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q12884 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]