FARP1

FARP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4H6Y
Ідентифікатори
Символи	FARP1, CDEP, FARP1-IT1, PLEKHC2, PPP1R75, FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602654 MGI: 2446173 HomoloGene: 38098 GeneCards: FARP1
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, fatty liver disease
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity • cytoskeletal protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • cell projection • мембрана • Філоподія • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • клітинна мембрана • dendritic spine • синапс • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • neuron projection • цитоскелет • цитоплазма Біологічний процес • dendrite morphogenesis • negative regulation of phosphatase activity • multicellular organism development • synapse assembly • regulation of Rho protein signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10160	223254
Ensembl	ENSG00000152767	ENSMUSG00000025555
UniProt	Q9Y4F1	F8VPU2
RefSeq (мРНК)	NM_001001715 NM_001286839 NM_005766	NM_134082
RefSeq (білок)	NP_001001715 NP_001273768 NP_005757	NP_598843
Локус (UCSC)	Хр. 13: 98.14 – 98.46 Mb	Хр. 14: 121.27 – 121.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FARP1 (англ. FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 045 амінокислот, а молекулярна маса — 118 633.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEIEQRPTP		GSRLGAPENS		GISTLERGQK		PPPTPSGKLV		SIKIQMLDDT
QEAFEVPQRA		PGKVLLDAVC		NHLNLVEGDY		FGLEFPDHKK		ITVWLDLLKP
IVKQIRRPKH		VVVKFVVKFF		PPDHTQLQEE		LTRYLFALQV		KQDLAQGRLT
CNDTSAALLI		SHIVQSEIGD		FDEALDREHL		AKNKYIPQQD		ALEDKIVEFH
HNHIGQTPAE		SDFQLLEIAR		RLEMYGIRLH		PAKDREGTKI		NLAVANTGIL
VFQGFTKINA		FNWAKVRKLS		FKRKRFLIKL		RPDANSAYQD		TLEFLMASRD
FCKSFWKICV		EHHAFFRLFE		EPKPKPKPVL		FSRGSSFRFS		GRTQKQVLDY
VKEGGHKKVQ		FERKHSKIHS		IRSLASQPTE		LNSEVLEQSQ		QSTSLTFGEG
AESPGGQSCR		RGKEPKVSAG		EPGSHPSPAP		RRSPAGNKQA		DGAASAPTEE
EEEVVKDRTQ		QSKPQPPQPS		TGSLTGSPHL		SELSVNSQGG		VAPANVTLSP
NLSPDTKQAS		PLISPLLNDQ		ACPRTDDEDE		GRRKRFPTDK		AYFIAKEVST
TERTYLKDLE		VITSWFQSTV		SKEDAMPEAL		KSLIFPNFEP		LHKFHTNFLK
EIEQRLALWE		GRSNAQIRDY		QRIGDVMLKN		IQGMKHLAAH		LWKHSEALEA
LENGIKSSRR		LENFCRDFEL		QKVCYLPLNT		FLLRPLHRLM		HYKQVLERLC
KHHPPSHADF		RDCRAALAEI		TEMVAQLHGT		MIKMENFQKL		HELKKDLIGI
DNLVVPGREF		IRLGSLSKLS		GKGLQQRMFF		LFNDVLLYTS		RGLTASNQFK
VHGQLPLYGM		TIEESEDEWG		VPHCLTLRGQ		RQSIIVAASS		RSEMEKWVED
IQMAIDLAEK		SSSPAPEFLA		SSPPDNKSPD		EATAADQESE		DDLSASRTSL
ERQAPHRGNT		MVHVCWHRNT		SVSMVDFSIA		VENQLSGNLL		RKFKNSNGWQ
KLWVVFTNFC		LFFYKSHQDN		HPLASLPLLG		YSLTIPSESE		NIQKDYVFKL
HFKSHVYYFR		AESEYTFERW		MEVIRSATSS		ASRPHVLSHK		ESLVY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах, синаптосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• He X., Kuo Y.C., Rosche T.J., Zhang X. (2013). Structural basis for autoinhibition of the guanine nucleotide exchange factor FARP2. Structure. 21: 355—364. PMID 23375260 DOI:10.1016/j.str.2013.01.001

Див. також

• Хромосома 13