FASTKD5

FASTKD5
Ідентифікатори
Символи	FASTKD5, dJ1187M17.5, FAST kinase domains 5
Зовнішні ІД	OMIM: 614272 MGI: 2139469 HomoloGene: 36400 GeneCards: FASTKD5
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase activity • rRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • ribonucleoprotein granule • mitochondrial nucleoid • мітохондрія Біологічний процес • клітинне дихання • protein phosphorylation • mRNA processing • mitochondrial RNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60493	380601
Ensembl	ENSG00000215251	ENSMUSG00000079043
UniProt	Q7L8L6	Q7TMV3
RefSeq (мРНК)	NM_021826	NM_001146084 NM_198176 NM_001377124 NM_001377125
RefSeq (білок)	NP_068598	NP_001139556 NP_937819 NP_001364053 NP_001364054
Локус (UCSC)	Хр. 20: 3.15 – 3.16 Mb	Хр. 2: 130.46 – 130.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FASTKD5 (англ. FAST kinase domains 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 764 амінокислот, а молекулярна маса — 86 574.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAATLKSLKL		VRYRAFCSPS		AFGAVRSVSY		WNVSSTQHGG		QDPPEHISLC
HSAKKVKNIC		STFSSRRILT		TSSAHPGLEF		SKTSSSKAST		LQLGSPRATG
VDEEDVEVFD		SFENMRVFLQ		LRPEYRVHSY		NASETSQLLS		VSEGELILHK
VRVNQNNLQA		QVIVDYLCKL		SSLPAEQHPV		LLGSTSFALL		CQLSVKKIQL
FDTQDLINVL		KAFVILGIPH		SHSMLDVYET		KCCHQVWEMN		MDQLLLVADL
WRYLGRKVPR		FLNIFSSYLN		LHWKDLSLSQ		LVHLIYVIGE		NRQVSQDLMQ
KLESLILKYI		DLINLEEVGT		ICLGFFKSST		NLSEFVMRKI		GDLACANIQH
LSSRSLVNIV		KMFRFTHVDH		INFMKQIGEI		APQRIPSLGV		QGVMHLTLYC
SALRFLNEGV		MNAVAASLPP		RVAHCRSKDV		AKILWSFGTL		NYKPPNAEEF
YSSLISEIHR		KMPEFNQYPE		HLPTCLLGLA		FLEYFPVELI		DFALSPGFVR
LAQERTKFDL		LKELYTLDGT		VGIECPDYRG		NRLSTHLQQE		GSELLWYLAE
KDMNSKPEFL		ETVFLLETML		GGPQYVKHHM		ILPHTRSSDL		EVQLDVNLKP
LPFNREATPA		ENVAKLRLEH		VGVSLTDDLM		NKLLKGKARG		HFQGKTESEP
GQQPMELENK		AAVPLGGFLC		NVADKSGAME		MAGLCPAACM		QTPRMKLAVQ
FTNRNQYCYG		SRDLLGLHNM		KRRQLARLGY		RVVELSYWEW		LPLLKRTRLE
KLAFLHEKVF		TSAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Antonicka H., Shoubridge E.A. (2015). Mitochondrial RNA granules are centers for posttranscriptional RNA processing and ribosome biogenesis. Cell Rep.: —. PMID 25683715 DOI:10.1016/j.celrep.2015.01.030

Див. також

• Хромосома 20