FAT1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
(Перенаправлено з FAT (протеин))
Перейти до навігації Перейти до пошуку
FAT1
Ідентифікатори
Символи FAT1, CDHF7, CDHR8, FAT, ME5, hFat1, FAT atypical cadherin 1
Зовнішні ІД OMIM: 600976 MGI: 109168 HomoloGene: 66302 GeneCards: FAT1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_005245
NM_001081286
NM_010179
RefSeq (білок)
NP_005236
н/д
Локус (UCSC) Хр. 4: 186.59 – 186.73 Mb Хр. 8: 45.39 – 45.51 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

FAT1 (англ. FAT atypical cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 588 амінокислот, а молекулярна маса — 506 273[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGRHLALLLLLLLLFQHFGDSDGSQRLEQTPLQFTHLEYNVTVQENSAAK
TYVGHPVKMGVYITHPAWEVRYKIVSGDSENLFKAEEYILGDFCFLRIRT
KGGNTAILNREVKDHYTLIVKALEKNTNVEARTKVRVQVLDTNDLRPLFS
PTSYSVSLPENTAIRTSIARVSATDADIGTNGEFYYSFKDRTDMFAIHPT
SGVIVLTGRLDYLETKLYEMEILAADRGMKLYGSSGISSMAKLTVHIEQA
NECAPVITAVTLSPSELDRDPAYAIVTVDDCDQGANGDIASLSIVAGDLL
QQFRTVRSFPGSKEYKVKAIGGIDWDSHPFGYNLTLQAKDKGTPPQFSSV
KVIHVTSPQFKAGPVKFEKDVYRAEISEFAPPNTPVVMVKAIPAYSHLRY
VFKSTPGKAKFSLNYNTGLISILEPVKRQQAAHFELEVTTSDRKASTKVL
VKVLGANSNPPEFTQTAYKAAFDENVPIGTTVMSLSAVDPDEGENGYVTY
SIANLNHVPFAIDHFTGAVSTSENLDYELMPRVYTLRIRASDWGLPYRRE
VEVLATITLNNLNDNTPLFEKINCEGTIPRDLGVGEQITTVSAIDADELQ
LVQYQIEAGNELDFFSLNPNSGVLSLKRSLMDGLGAKVSFHSLRITATDG
ENFATPLYINITVAASHKLVNLQCEETGVAKMLAEKLLQANKLHNQGEVE
DIFFDSHSVNAHIPQFRSTLPTGIQVKENQPVGSSVIFMNSTDLDTGFNG
KLVYAVSGGNEDSCFMIDMETGMLKILSPLDRETTDKYTLNITVYDLGIP
QKAAWRLLHVVVVDANDNPPEFLQESYFVEVSEDKEVHSEIIQVEATDKD
LGPNGHVTYSIVTDTDTFSIDSVTGVVNIARPLDRELQHEHSLKIEARDQ
AREEPQLFSTVVVKVSLEDVNDNPPTFIPPNYRVKVREDLPEGTVIMWLE
AHDPDLGQSGQVRYSLLDHGEGNFDVDKLSGAVRIVQQLDFEKKQVYNLT
VRAKDKGKPVSLSSTCYVEVEVVDVNENLHPPVFSSFVEKGTVKEDAPVG
SLVMTVSAHDEDARRDGEIRYSIRDGSGVGVFKIGEETGVIETSDRLDRE
STSHYWLTVFATDQGVVPLSSFIEIYIEVEDVNDNAPQTSEPVYYPEIME
NSPKDVSVVQIEAFDPDSSSNDKLMYKITSGNPQGFFSIHPKTGLITTTS
RKLDREQQDEHILEVTVTDNGSPPKSTIARVIVKILDENDNKPQFLQKFY
KIRLPEREKPDRERNARREPLYHVIATDKDEGPNAEISYSIEDGNEHGKF
FIEPKTGVVSSKRFSAAGEYDILSIKAVDNGRPQKSSTTRLHIEWISKPK
PSLEPISFEESFFTFTVMESDPVAHMIGVISVEPPGIPLWFDITGGNYDS
HFDVDKGTGTIIVAKPLDAEQKSNYNLTVEATDGTTTILTQVFIKVIDTN
DHRPQFSTSKYEVVIPEDTAPETEILQISAVDQDEKNKLIYTLQSSRDPL
SLKKFRLDPATGSLYTSEKLDHEAVHQHTLTVMVRDQDVPVKRNFARIVV
NVSDTNDHAPWFTASSYKGRVYESAAVGSVVLQVTALDKDKGKNAEVLYS
IESGNIGNSFMIDPVLGSIKTAKELDRSNQAEYDLMVKATDKGSPPMSEI
TSVRIFVTIADNASPKFTSKEYSVELSETVSIGSFVGMVTAHSQSSVVYE
IKDGNTGDAFDINPHSGTIITQKALDFETLPIYTLIIQGTNMAGLSTNTT
VLVHLQDENDNAPVFMQAEYTGLISESASINSVVLTDRNVPLVIRAADAD
KDSNALLVYHIVEPSVHTYFAIDSSTGAIHTVLSLDYEETSIFHFTVQVH
DMGTPRLFAEYAANVTVHVIDINDCPPVFAKPLYEASLLLPTYKGVKVIT
VNATDADSSAFSQLIYSITEGNIGEKFSMDYKTGALTVQNTTQLRSRYEL
TVRASDGRFAGLTSVKINVKESKESHLKFTQDVYSAVVKENSTEAETLAV
ITAIGNPINEPLFYHILNPDRRFKISRTSGVLSTTGTPFDREQQEAFDVV
VEVTEEHKPSAVAHVVVKVIVEDQNDNAPVFVNLPYYAVVKVDTEVGHVI
RYVTAVDRDSGRNGEVHYYLKEHHEHFQIGPLGEISLKKQFELDTLNKEY
LVTVVAKDGGNPAFSAEVIVPITVMNKAMPVFEKPFYSAEIAESIQVHSP
VVHVQANSPEGLKVFYSITDGDPFSQFTINFNTGVINVIAPLDFEAHPAY
KLSIRATDSLTGAHAEVFVDIIVDDINDNPPVFAQQSYAVTLSEASVIGT
SVVQVRATDSDSEPNRGISYQMFGNHSKSHDHFHVDSSTGLISLLRTLDY
EQSRQHTIFVRAVDGGMPTLSSDVIVTVDVTDLNDNPPLFEQQIYEARIS
EHAPHGHFVTCVKAYDADSSDIDKLQYSILSGNDHKHFVIDSATGIITLS
NLHRHALKPFYSLNLSVSDGVFRSSTQVHVTVIGGNLHSPAFLQNEYEVE
LAENAPLHTLVMEVKTTDGDSGIYGHVTYHIVNDFAKDRFYINERGQIFT
LEKLDRETPAEKVISVRLMAKDAGGKVAFCTVNVILTDDNDNAPQFRATK
YEVNIGSSAAKGTSVVKVLASDADEGSNADITYAIEADSESVKENLEINK
LSGVITTKESLIGLENEFFTFFVRAVDNGSPSKESVVLVYVKILPPEMQL
PKFSEPFYTFTVSEDVPIGTEIDLIRAEHSGTVLYSLVKGNTPESNRDES
FVIDRQSGRLKLEKSLDHETTKWYQFSILARCTQDDHEMVASVDVSIQVK
DANDNSPVFESSPYEAFIVENLPGGSRVIQIRASDADSGTNGQVMYSLDQ
SQSVEVIESFAINMETGWITTLKELDHEKRDNYQIKVVASDHGEKIQLSS
TAIVDVTVTDVNDSPPRFTAEIYKGTVSEDDPQGGVIAILSTTDADSEEI
NRQVTYFITGGDPLGQFAVETIQNEWKVYVKKPLDREKRDNYLLTITATD
GTFSSKAIVEVKVLDANDNSPVCEKTLYSDTIPEDVLPGKLIMQISATDA
DIRSNAEITYTLLGSGAEKFKLNPDTGELKTSTPLDREEQAVYHLLVRAT
DGGGRFCQASIVLTLEDVNDNAPEFSADPYAITVFENTEPGTLLTRVQAT
DADAGLNRKILYSLIDSADGQFSINELSGIIQLEKPLDRELQAVYTLSLK
AVDQGLPRRLTATGTVIVSVLDINDNPPVFEYREYGATVSEDILVGTEVL
QVYAASRDIEANAEITYSIISGNEHGKFSIDSKTGAVFIIENLDYESSHE
YYLTVEATDGGTPSLSDVATVNVNVTDINDNTPVFSQDTYTTVISEDAVL
EQSVITVMADDADGPSNSHIHYSIIDGNQGSSFTIDPVRGEVKVTKLLDR
ETISGYTLTVQASDNGSPPRVNTTTVNIDVSDVNDNAPVFSRGNYSVIIQ
ENKPVGFSVLQLVVTDEDSSHNGPPFFFTIVTGNDEKAFEVNPQGVLLTS
SAIKRKEKDHYLLQVKVADNGKPQLSSLTYIDIRVIEESIYPPAILPLEI
FITSSGEEYSGGVIGKIHATDQDVYDTLTYSLDPQMDNLFSVSSTGGKLI
AHKKLDIGQYLLNVSVTDGKFTTVADITVHIRQVTQEMLNHTIAIRFANL
TPEEFVGDYWRNFQRALRNILGVRRNDIQIVSLQSSEPHPHLDVLLFVEK
PGSAQISTKQLLHKINSSVTDIEEIIGVRILNVFQKLCAGLDCPWKFCDE
KVSVDESVMSTHSTARLSFVTPRHHRAAVCLCKEGRCPPVHHGCEDDPCP
EGSECVSDPWEEKHTCVCPSGRFGQCPGSSSMTLTGNSYVKYRLTENENK
LEMKLTMRLRTYSTHAVVMYARGTDYSILEIHHGRLQYKFDCGSGPGIVS
VQSIQVNDGQWHAVALEVNGNYARLVLDQVHTASGTAPGTLKTLNLDNYV
FFGGHIRQQGTRHGRSPQVGNGFRGCMDSIYLNGQELPLNSKPRSYAHIE
ESVDVSPGCFLTATEDCASNPCQNGGVCNPSPAGGYYCKCSALYIGTHCE
ISVNPCSSKPCLYGGTCVVDNGGFVCQCRGLYTGQRCQLSPYCKDEPCKN
GGTCFDSLDGAVCQCDSGFRGERCQSDIDECSGNPCLHGALCENTHGSYH
CNCSHEYRGRHCEDAAPNQYVSTPWNIGLAEGIGIVVFVAGIFLLVVVFV
LCRKMISRKKKHQAEPKDKHLGPATAFLQRPYFDSKLNKNIYSDIPPQVP
VRPISYTPSIPSDSRNNLDRNSFEGSAIPEHPEFSTFNPESVHGHRKAVA
VCSVAPNLPPPPPSNSPSDSDSIQKPSWDFDYDTKVVDLDPCLSKKPLEE
KPSQPYSARESLSEVQSLSSFQSESCDDNGYHWDTSDWMPSVPLPDIQEF
PNYEVIDEQTPLYSADPNAIDTDYYPGGYDIESDFPPPPEDFPAADELPP
LPPEFSNQFESIHPPRDMPAAGSLGSSSRNRQRFNLNQYLPNFYPLDMSE
PQTKGTGENSTCREPHAPYPPGYQRHFEAPAVESMPMSVYASTASCSDVS
ACCEVESEVMMSDYESGDDGHFEEVTIPPLDSQQHTEV

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

[ред. | ред. код]
  • Magg T., Schreiner D., Solis G.P., Bade E.G., Hofer H.W. (2005). Processing of the human protocadherin Fat1 and translocation of its cytoplasmic domain to the nucleus. Exp. Cell Res. 307: 100—108. PMID 15922730 DOI:10.1016/j.yexcr.2005.03.006
  • Hou R., Sibinga N.E. (2009). Atrophin proteins interact with the Fat1 cadherin and regulate migration and orientation in vascular smooth muscle cells. J. Biol. Chem. 284: 6955—6965. PMID 19131340 DOI:10.1074/jbc.M809333200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3595 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, Q14517 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]