FBXO6

FBXO6
Ідентифікатори
Символи	FBXO6, FBG2, FBS2, FBX6, Fbx6b, F-box protein 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605647 MGI: 1354743 HomoloGene: 9274 GeneCards: FBXO6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • carbohydrate binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • SCF ubiquitin ligase complex • endoplasmic reticulum quality control compartment • гіалоплазма Біологічний процес • cellular response to DNA damage stimulus • DNA damage checkpoint signaling • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • response to unfolded protein • GO:0100026 Репарація ДНК • Убіквітин-залежний протеоліз • протеоліз • ubiquitin-dependent ERAD pathway • glycoprotein catabolic process • protein polyubiquitination • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26270	50762
Ensembl	ENSG00000116663	ENSMUSG00000055401
UniProt	Q9NRD1	Q9QZN4
RefSeq (мРНК)	NM_018438	NM_001163704 NM_001163705 NM_001163706 NM_001163707 NM_015797
RefSeq (білок)	NP_060908	NP_001157176 NP_001157177 NP_001157178 NP_001157179 NP_056612
Локус (UCSC)	Хр. 1: 11.66 – 11.67 Mb	Хр. 4: 148.23 – 148.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FBXO6 (англ. F-box protein 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 933.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAPHSKAAL		DSINELPENI		LLELFTHVPA		RQLLLNCRLV		CSLWRDLIDL
MTLWKRKCLR		EGFITKDWDQ		PVADWKIFYF		LRSLHRNLLR		NPCAEEDMFA
WQIDFNGGDR		WKVESLPGAH		GTDFPDPKVK		KYFVTSYEMC		LKSQLVDLVA
EGYWEELLDT		FRPDIVVKDW		FAARADCGCT		YQLKVQLASA		DYFVLASFEP
PPVTIQQWNN		ATWTEVSYTF		SDYPRGVRYI		LFQHGGRDTQ		YWAGWYGPRV
TNSSIVVSPK		MTRNQASSEA		QPGQKHGQEE		AAQSPYRAVV		QIF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як відповідь на порушення конформації білку, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Ilyin G.P., Rialland M., Pigeon C., Guguen-Guillouzo C. (2000). cDNA cloning and expression analysis of new members of the mammalian F-box protein family. Genomics. 67: 40—47. PMID 10945468 DOI:10.1006/geno.2000.6211
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Glenn K.A., Nelson R.F., Wen H.M., Mallinger A.J., Paulson H.L. (2008). Diversity in tissue expression, substrate binding, and SCF complex formation for a lectin family of ubiquitin ligases. J. Biol. Chem. 283: 12717—12729. PMID 18203720 DOI:10.1074/jbc.M709508200

Див. також

• Хромосома 1