FERMT1

FERMT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KMC, 4BBK
Ідентифікатори
Символи	FERMT1, C20orf42, DTGCU2, KIND1, UNC112A, URP1, fermitin family member 1, FERM domain containing kindlin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607900 MGI: 2443583 HomoloGene: 9773 GeneCards: FERMT1
Пов'язані генетичні захворювання
Kindler syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • actin filament binding Клітинна компонента • cell projection • ruffle membrane • гіалоплазма • міжклітинні контакти • filamentous actin • клітинна мембрана • мембрана • focal adhesion • цитоплазма • цитоскелет Біологічний процес • keratinocyte proliferation • адгезія клітин • keratinocyte migration • establishment of epithelial cell polarity • positive regulation of cell-matrix adhesion • negative regulation of gene expression • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • negative regulation of protein import into nucleus • negative regulation of timing of anagen • basement membrane organization • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of stem cell proliferation • integrin-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55612	241639
Ensembl	ENSG00000101311	ENSMUSG00000027356
UniProt	Q9BQL6	P59113
RefSeq (мРНК)	NM_017671	NM_198029
RefSeq (білок)	NP_060141	NP_932146
Локус (UCSC)	Хр. 20: 6.07 – 6.12 Mb	Хр. 2: 132.75 – 132.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FERMT1 (англ. Fermitin family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 677 амінокислот, а молекулярна маса — 77 437.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLSSTDFTFA		SWELVVRVDH		PNEEQQKDVT		LRVSGDLHVG		GVMLKLVEQI
NISQDWSDFA		LWWEQKHCWL		LKTHWTLDKY		GVQADAKLLF		TPQHKMLRLR
LPNLKMVRLR		VSFSAVVFKA		VSDICKILNI		RRSEELSLLK		PSGDYFKKKK
KKDKNNKEPI		IEDILNLESS		PTASGSSVSP		GLYSKTMTPI		YDPINGTPAS
STMTWFSDSP		LTEQNCSILA		FSQPPQSPEA		LADMYQPRSL		VDKAKLNAGW
LDSSRSLMEQ		GIQEDEQLLL		RFKYYSFFDL		NPKYDAVRIN		QLYEQARWAI
LLEEIDCTEE		EMLIFAALQY		HISKLSLSAE		TQDFAGESEV		DEIEAALSNL
EVTLEGGKAD		SLLEDITDIP		KLADNLKLFR		PKKLLPKAFK		QYWFIFKDTS
IAYFKNKELE		QGEPLEKLNL		RGCEVVPDVN		VAGRKFGIKL		LIPVADGMNE
MYLRCDHENQ		YAQWMAACML		ASKGKTMADS		SYQPEVLNIL		SFLRMKNRNS
ASQVASSLEN		MDMNPECFVS		PRCAKRHKSK		QLAARILEAH		QNVAQMPLVE
AKLRFIQAWQ		SLPEFGLTYY		LVRFKGSKKD		DILGVSYNRL		IKIDAATGIP
VTTWRFTNIK		QWNVNWETRQ		VVIEFDQNVF		TAFTCLSADC		KIVHEYIGGY
IFLSTRSKDQ		NETLDEDLFH		KLTGGQD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20