FGD3

FGD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2COC
Ідентифікатори
Символи	FGD3, ZFYVE5, FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3
Зовнішні ІД	OMIM: 617554 MGI: 1353657 HomoloGene: 22925 GeneCards: FGD3
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • small GTPase binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • ruffle • Цитоскелет • lamellipodium Біологічний процес • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • filopodium assembly • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • positive regulation of apoptotic process • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • actin cytoskeleton organization • G protein-coupled receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	89846	30938
Ensembl	ENSG00000127084	ENSMUSG00000037946
UniProt	Q5JSP0	O88842
RefSeq (мРНК)	NM_001083536 NM_001286993 NM_033086 NM_001369951 NM_001369952	NM_015759
RefSeq (білок)	NP_001077005 NP_001273922 NP_149077 NP_001356880 NP_001356881 NP_001077005.1 NP_149077.2	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 9: 92.95 – 93.04 Mb	Хр. 13: 49.42 – 49.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FGD3 (англ. FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 725 амінокислот, а молекулярна маса — 79 401.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESGRGSSTP		PGPIAALGMP		DTGPGSSSLG		KLQALPVGPR		AHCGDPVSLA
AAGDGSPDIG		PTGELSGSLK		IPNRDSGIDS		PSSSVAGENF		PCEEGLEAGP
SPTVLGAHAE		MALDSQVPKV		TPQEEADSDV		GEEPDSENTP		QKADKDAGLA
QHSGPQKLLH		IAQELLHTEE		TYVKRLHLLD		QVFCTRLTDA		GIPPEVIMGI
FSNISSIHRF		HGQFLLPELK		TRITEEWDTN		PRLGDILQKL		APFLKMYGEY
VKNFDRAVGL		VSTWTQRSPL		FKDVVHSIQK		QEVCGNLTLQ		HHMLEPVQRV
PRYELLLKDY		LKRLPQDAPD		RKDAERSLEL		ISTAANHSNA		AIRKVEKMHK
LLEVYEQLGG		EEDIVNPANE		LIKEGQIQKL		SAKNGTPQDR		HLFLFNSMIL
YCVPKLRLMG		QKFSVREKMD		ISGLQVQDIV		KPNTAHTFII		TGRKRSLELQ
TRTEEEKKEW		IQIIQATIEK		HKQNSETFKA		FGGAFSQDED		PSLSPDMPIT
STSPVEPVVT		TEGSSGAAGL		EPRKLSSKTR		RDKEKQSCKS		CGETFNSITK
RRHHCKLCGA		VICGKCSEFK		AENSRQSRVC		RDCFLTQPVA		PESTEKTPTA
DPQPSLLCGP		LRLSESGETW		SEVWAAIPMS		DPQVLHLQGG		SQDGRLPRTI
PLPSCKLSVP		DPEERLDSGH		VWKLQWAKQS		WYLSASSAEL		QQQWLETLST
AAHGDTAQDS		PGALQLQVPM		GAAAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9