FGD5

FGD5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3MPX
Ідентифікатори
Символи	FGD5, ZFYVE23, FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5
Зовнішні ІД	OMIM: 614788 MGI: 2443369 HomoloGene: 27798 GeneCards: FGD5
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • small GTPase binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • cell projection • комплекс Ґольджі • lamellipodium • early endosome • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • ruffle • ruffle membrane • клітинна мембрана • ендосома • цитоскелет Біологічний процес • regulation of Rho protein signal transduction • cytoskeleton organization • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • filopodium assembly • regulation of cell shape • actin cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	152273	232237
Ensembl	ENSG00000154783	ENSMUSG00000034037
UniProt	Q6ZNL6	Q80UZ0
RefSeq (мРНК)	NM_152536 NM_001320276	NM_172731
RefSeq (білок)	NP_001307205 NP_689749	NP_766319
Локус (UCSC)	Хр. 3: 14.81 – 14.93 Mb	Хр. 6: 91.96 – 92.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FGD5 (англ. FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 462 амінокислот, а молекулярна маса — 159 891.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFRGPKPPIA		PKPRLTAPNE		WRASVYLNDS		LNKCSNGRLP		CVDRGLDEGP
RSIPKCSESE		TDEDYIVVPR		VPLREDEPKD		EGSVGNKALV		SPESSAEEEE
EREEGGEACG		LEGTGAGEDS		VAPAAPGAGA		LSREGEEGTD		LALEDEGEGC
ADEPGTLEQV		SRSEEEEKLV		QPHRECSLED		SGPWAGEGVF		QSDLLLPHIH
GEDQEPPDTP		GEAEEDDEEG		CASTDPAGAD		EGSGPDRPTE		DMGQDAEDTS
EEPPEKEELA		GVQEAETATD		CPEVLEEGCE		EATGVTGGEQ		VDLSEPPDHE
KKTNQEVAAA		TLEDHAQDES		AEESCQIVPF		ENDCMEDFVT		SLTGSPYEFF
PTESTSFCSE		SCSPLSESAK		GLESEQAPKL		GLRAEENPMV		GALCGQCGSL
QGGAAEGPAA		PDVVVVLEEE		ALDDALANPY		VMGVGLPGQA		APGEGGQAAS
DALGGYGSKE		ELNCEAEGGL		VPADRKNTST		RVRPHSGKVA		GYVPETVPEE
TGPEAGSSAP		GIGGAAEEVG		KTLLSLEGKP		LEASRALPAK		PRAFTLYPRS
FSVEGREIPV		SVYQEPEGSG		LDDHRIKRKE		DNLSLSCVIG		SSGSFSQRNH
LPSSGTSTPS		SMVDIPPPFD		LACITKKPIT		KSSPSLLIES		DSPDKYKKKK
SSFKRFLALT		FKKKTENKLH		VDVNVSSSRS		SSESSYHGPS		RILEVDRRSL
SNSPQLKSRT		GKLRASESPS		SLIFYRDGKR		KGVPFSRTVS		RVESFEDRSR
PPFLPLPLTK		PRSISFPSAD		TSDYENIPAM		NSDYENIQIP		PRRPARAGAF
TKLFEDQSRA		LSTANENDGY		VDMSSFNAFE		SKQQSADQDA		ESAYTEPYKV
CPISSAAPKE		DLTSDEEQRS		SEEEDSASRD		PSVTHKVEGQ		SRALVIAQEL
LSSEKAYVEM		LQHLNLDFHG		AVMRALDDMD		HEGRDTLARE		ELRQGLSELP
AIHDLHQGIL		EELEERLSNW		ESQQKVADVF		LAREQGFDHH		ATHILQFDRY
LGLLSENCLH		SPRLAAAVRE		FEQSVQGGSQ		TAKHRLLRVV		QRLFQYQVLL
TDYLNNLCPD		SAEYDNTQGA		LSLISKVTDR		ANDSMEQGEN		LQKLVHIEHS
VRGQGDLLQP		GREFLKEGTL		MKVTGKNRRP		RHLFLMNDVL		LYTYPQKDGK
YRLKNTLAVA		NMKVSRPVME		KVPYALKIET		SESCLMLSAS		SCAERDEWYG
CLSRALPEDY		KAQALAAFHH		SVEIRERLGV		SLGERPPTLV		PVTHVMMCMN
CGCDFSLTLR		RHHCHACGKI		VCRNCSRNKY		PLKYLKDRMA		KVCDGCFGEL
KKRGRAVPGL		MRERPVSMSF		PLSSPRFSGS		AFSSVFQSIN		PSTFKKQKKV
PSALTEVAAS		GEGSAISGYL		SRCKRGKRHW		KKLWFVIKGK		VLYTYMASED
KVALESMPLL		GFTIAPEKEE		GSSEVGPIFH		LYHKKTLFYS		FKAEDTNSAQ
RWIEAMEDAS		VL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3