FLRT3

FLRT3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5CMN, 5CMP
Ідентифікатори
Символи	FLRT3, HH21, fibronectin leucine rich transmembrane protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604808 MGI: 1918686 HomoloGene: 8322 GeneCards: FLRT3
Пов'язані генетичні захворювання
hypogonadotropic hypogonadism 21 with or without anosmia
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • protein homodimerization activity • fibroblast growth factor receptor binding • protein kinase inhibitor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chemorepellent activity Клітинна компонента • цитоплазма • axon terminus • integral component of membrane • synaptic membrane • cell projection • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • cell-cell junction • focal adhesion • axonal growth cone • integral component of plasma membrane • extracellular region • аксон • ендоплазматичний ретикулум • міжклітинний простір • гіалоплазма • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • GO:0005578 Позаклітинна матриця • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic membrane Біологічний процес • negative chemotaxis • negative regulation of protein kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • head development • neuron projection extension • axon guidance • multicellular organism development • heart development • адгезія клітин • response to axon injury • embryonic morphogenesis • proepicardium cell migration involved in pericardium morphogenesis • synapse assembly • neuron projection development • negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • positive regulation of synapse assembly • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules • synaptic membrane adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23767	71436
Ensembl	ENSG00000125848	ENSMUSG00000051379
UniProt	Q9NZU0	Q8BGT1
RefSeq (мРНК)	NM_013281 NM_198391	NM_001172160 NM_178382
RefSeq (білок)	NP_037413 NP_938205	NP_001165631 NP_848469
Локус (UCSC)	Хр. 20: 14.32 – 14.34 Mb	Хр. 2: 140.49 – 140.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FLRT3 (англ. Fibronectin leucine rich transmembrane protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 649 амінокислот, а молекулярна маса — 73 004.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MISAAWSIFL		IGTKIGLFLQ		VAPLSVMAKS		CPSVCRCDAG		FIYCNDRFLT
SIPTGIPEDA		TTLYLQNNQI		NNAGIPSDLK		NLLKVERIYL		YHNSLDEFPT
NLPKYVKELH		LQENNIRTIT		YDSLSKIPYL		EELHLDDNSV		SAVSIEEGAF
RDSNYLRLLF		LSRNHLSTIP		WGLPRTIEEL		RLDDNRISTI		SSPSLQGLTS
LKRLVLDGNL		LNNHGLGDKV		FFNLVNLTEL		SLVRNSLTAA		PVNLPGTNLR
KLYLQDNHIN		RVPPNAFSYL		RQLYRLDMSN		NNLSNLPQGI		FDDLDNITQL
ILRNNPWYCG		CKMKWVRDWL		QSLPVKVNVR		GLMCQAPEKV		RGMAIKDLNA
ELFDCKDSGI		VSTIQITTAI		PNTVYPAQGQ		WPAPVTKQPD		IKNPKLTKDH
QTTGSPSRKT		ITITVKSVTS		DTIHISWKLA		LPMTALRLSW		LKLGHSPAFG
SITETIVTGE		RSEYLVTALE		PDSPYKVCMV		PMETSNLYLF		DETPVCIETE
TAPLRMYNPT		TTLNREQEKE		PYKNPNLPLA		AIIGGAVALV		TIALLALVCW
YVHRNGSLFS		RNCAYSKGRR		RKDDYAEAGT		KKDNSILEIR		ETSFQMLPIS
NEPISKEEFV		IHTIFPPNGM		NLYKNNHSES		SSNRSYRDSG		IPDSDHSHS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках. Також секретований назовні.

Література

• Lacy S.E., Bonnemann C.G., Buzney E.A., Kunkel L.M. (1999). Identification of FLRT1, FLRT2, and FLRT3: a novel family of transmembrane leucine-rich repeat proteins. Genomics. 62: 417—426. PMID 10644439 DOI:10.1006/geno.1999.6033
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20