FNIP1

FNIP1
Ідентифікатори
Символи	FNIP1, folliculin interacting protein 1, IMD93
Зовнішні ІД	OMIM: 610594 MGI: 2444668 HomoloGene: 28173 GeneCards: FNIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • ATPase inhibitor activity • chaperone binding Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • regulation of protein phosphorylation • regulation of pro-B cell differentiation • cellular response to starvation • negative regulation of TOR signaling • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • positive regulation of protein phosphorylation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • TOR signaling • positive regulation of B cell apoptotic process • positive regulation of protein-containing complex assembly • immature B cell differentiation • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • mitochondrion organization • TORC1 signaling • negative regulation of mitochondrion organization • negative regulation of TORC1 signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	96459	216742
Ensembl	ENSG00000217128	ENSMUSG00000035992
UniProt	Q8TF40	Q68FD7
RefSeq (мРНК)	NM_133372 NM_001008738 NM_001346113 NM_001346114	NM_173753
RefSeq (білок)	NP_001008738 NP_001333042 NP_001333043 NP_588613	NP_776114
Локус (UCSC)	Хр. 5: 131.64 – 131.8 Mb	Хр. 11: 54.33 – 54.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FNIP1 (англ. Folliculin interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 166 амінокислот, а молекулярна маса — 130 555.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPTLFQKLF		SKRTGLGAPG		RDARDPDCGF		SWPLPEFDPS		QIRLIVYQDC
ERRGRNVLFD		SSVKRRNEDI		SVSKLGSDAQ		VKVFGKCCQL		KPGGDSSSSL
DSSVTSSSDI		KDQCLKYQGS		RCSSDANMLG		EMMFGSVAMS		YKGSTLKIHQ
IRSPPQLMLS		KVFTARTGSS		ICGSLNTLQD		SLEFINQDNN		TLKADNNTVI
NGLLGNIGLS		QFCSPRRAFS		EQGPLRLIRS		ASFFAVHSNP		MDMPGRELNE
DRDSGIARSA		SLSSLLITPF		PSPNSSLTRS		CASSYQRRWR		RSQTTSLENG
VFPRWSIEES		FNLSDESCGP		NPGIVRKKKI		AIGVIFSLSK		DEDENNKFNE
FFFSHFPLFE		SHMNKLKSAI		EQAMKMSRRS		ADASQRSLAY		NRIVDALNEF
RTTICNLYTM		PRIGEPVWLT		MMSGTPEKNH		LCYRFMKEFT		FLMENASKNQ
FLPALITAVL		TNHLAWVPTV		MPNGQPPIKI		FLEKHSSQSV		DMLAKTHPYN
PLWAQLGDLY		GAIGSPVRLA		RTVVVGKRQD		MVQRLLYFLT		YFIRCSELQE
THLLENGEDE		AIVMPGTVIT		TTLEKGEIEE		SEYVLVTMHR		NKSSLLFKES
EEIRTPNCNC		KYCSHPLLGQ		NVENISQQER		EDIQNSSKEL		LGISDECQMI
SPSDCQEENA		VDVKQYRDKL		RTCFDAKLET		VVCTGSVPVD		KCALSESGLE
STEETWQSEK		LLDSDSHTGK		AMRSTGMVVE		KKPPDKIVPA		SFSCEAAQTK
VTFLIGDSMS		PDSDTELRSQ		AVVDQITRHH		TKPLKEERGA		IDQHQETKQT
TKDQSGESDT		QNMVSEEPCE		LPCWNHSDPE		SMSLFDEYFN		DDSIETRTID
DVPFKTSTDS		KDHCCMLEFS		KILCTKNNKQ		NNEFCKCIET		VPQDSCKTCF
PQQDQRDTLS		ILVPHGDKES		SDKKIAVGTE		WDIPRNESSD		SALGDSESED
TGHDMTRQVS		SYYGGEQEDW		AEEDEIPFPG		SKLIEVSAVQ		PNIANFGRSL
LGGYCSSYVP		DFVLQGIGSD		ERFRQCLMSD		LSHAVQHPVL		DEPIAEAVCI
IADMDKWTVQ		VASSQRRVTD		NKLGKEVLVS		SLVSNLLHST		LQLYKHNLSP
NFCVMHLEDR		LQELYFKSKM		LSEYLRGQMR		VHVKELGVVL		GIESSDLPLL
AAVASTHSPY		VAQILL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319

Див. також

• Хромосома 5