FOCAD

FOCAD
Ідентифікатори
Символи	FOCAD, KIAA1797, focadhesin
Зовнішні ІД	OMIM: 614606 MGI: 2676921 HomoloGene: 9842 GeneCards: FOCAD
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54914	230393
Ensembl	ENSG00000188352	ENSMUSG00000038368
UniProt	Q5VW36	A2AKG8
RefSeq (мРНК)	NM_017794 NM_001375567 NM_001375568 NM_001375570	NM_001081184
RefSeq (білок)	NP_060264 NP_001362496 NP_001362497 NP_001362499	NP_001074653
Локус (UCSC)	Хр. 9: 20.66 – 21 Mb	Хр. 4: 88.09 – 88.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOCAD (англ. Focadhesin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 801 амінокислот, а молекулярна маса — 200 072.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDDIRKRFE		FPNSLIQSQA		VGHLIAAVLK		ENGFSEKIHQ		STNQTPALNL
LWEKCCSDNV		VVRTACCEGL		VALVAQDHAE		FSYVLNGILN		LIPSTRNTHG
LIKAIMHLLQ		MQALKEGQGG		EKNIQSIYTI		RNHPHPLITV		LEHRPDCWPV
FLQQLTAFFQ		QCPERLEVSC		IQIMAPFLWY		LYCEPSQLQE		YAKLRLALLK
VLLQPQVLCD		KDQPSILEQQ		ILQLCCDIVP		CLQVKDLIQT		TEAMMFIEEV
CLSLLRHPVF		WKIQLTQMSL		QLLCVSEVSL		KITGECSSSI		HLLEHSVELL
KEDFPVELVI		IGIALLLLQT		PASQQKPILN		LALKLLSVTE		DQKIPKSSLL
LVMPILQILS		STALEDCISV		DEEGPSRQQL		ALNLLEMIQQ		ECYRDDHQKL
SYKLVCPVTS		MYGTIFTAWR		ILEVMTDSSA		ASDWLASVES		LLPITAVIPA
PAFLLLAHLL		VEDKGQNLHQ		ILKVTTELAQ		ADSSQVPNLI		PVLMFKLGRP
LEPILYNDIL		YTLPKLGVHK		VCIGQILRII		QLLGTTPRLR		AVTLRLLTSL
WEKQDRVYPE		LQRFMAVSDV		PSLSVGKEVQ		WEKLIAKAAS		IRDICKQRPY
QHGADMLAAI		SQVLNECTKP		DQATPAALVL		QGLHALCQAE		VVCIRSTWNA
LSPKLSCDTR		PLILKTLSEL		FSLVPSLTVN		TTEYENFKVQ		VLSFLWTHTQ
NKDPIVANAA		YRSLANFTAG		EHTILHLPEK		IRPEIPIPEE		LDDDEDVEDV
DLSVPGSCYL		KLLSLTPPLV		LPALEEFFTS		LVKQEMVNMP		RGIYHSALKG
GARSDQGKTV		AGIPNFILKM		YETNKQPGLK		PGLAGGMLFC		YDVSMYQSKD
GKPLNRLMAS		RGRSFKQTSL		ALVHEVHIQL		SEWHRAIFLP		QAWLAYMNRA
YHAILQGRLG		ELELQLKHGK		EEPEEVQYKK		STAWLWVRDM		LTDEITKAAA
KESPVVKGNA		LLALSSLAVV		VSRHEASLSS		DSDGLLEVQP		NFLSMKEWVS
MVLDTLLVIV		DSHYQPRGQL		LSWFYYKSYS		GENTASAIAR		SAAATALSLL
VPVFIISCKE		KVEEILNMLT		ARLPGKPSAD		ESQAVQIHMG		LALGMFLSRL
CEEKLSDISG		QEMNLLLMKS		LDALENCCFD		TSLEYNTGCI		LGVGLVLSLM
SHSSQMQSRV		HVAALLRKLS		AHVDDSGSQS		RTFQEVLAYT		LSCVCTSAFS
AGIIEATEAE		DVMNKLRLLV		ENSQQTSGFA		LALGNIVHGL		SVCGHGKAED
LGSKLLPAWI		RIVLTEGTPT		MLCLAALHGM		VALVGSEGDV		MQLKSEAIQT
SHFQGRLNEV		IRTLTQVISV		SGVIGLQSNA		VWLLGHLHLS		TLSSSQSRAS
VPTDYSYLPE		SSFIGAAIGF		FITGGKKGPE		SVPPSLLKVV		MKPIATVGES
YQYPPVNWAA		LLSPLMRLNF		GEEIQQLCLE		IMVTQAQSSQ		NAAALLGLWV
TPPLIHSLSL		NTKRYLLISA		PLWIKHISDE		QILGFVENLM		VAVFKAASPL
GSPELCPSAL		HGLSQAMKLP		SPAHHLWSLL		SEATGKIFDL		LPNKIRRKDL
ELYISIAKCL		LEMTDDDANR		IAQVTKSNIE		KAAFVKLYLV		SQGRFPLVNL
TDMLSVAVQH		REKEVLAWMI		LHSLYQARIV		SHANTGVLKR		MEWLLELMGY
IRNVAYQSTS		FHNTALDKAL		DFFLLIFATA		VVAWADHTAP		LLLGLSASWL
PWHQENGPAG		PVPSFLGRSP		MHRVTLQEVL		TLLPNSMALL		LQKEPWKEQT
QKFIDWLFSI		MESPKEALSA		QSRDLLKATL		LSLRVLPEFK		KKAVWTRAYG
W

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Matlik K., Redik K., Speek M. (2006). L1 antisense promoter drives tissue-specific transcription of human genes. J. Biomed. Biotechnol. 2006: 71753—71753. PMID 16877819 DOI:10.1155/JBB/2006/71753

Див. також

• Хромосома 9