GAPVD1

GAPVD1
Ідентифікатори
Символи	GAPVD1, GAPEX5, GAPex-5, RAP6, GTPase activating protein and VPS9 domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611714 MGI: 1913941 HomoloGene: 32637 GeneCards: GAPVD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GTPase activating protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • guanyl-nucleotide exchange factor activity • cadherin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • ендосома • мембрана • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • ендоцитоз • regulation of protein transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • membrane organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26130	66691
Ensembl	ENSG00000165219	ENSMUSG00000026867
UniProt	Q14C86	Q6PAR5
RefSeq (мРНК)	NM_001282679 NM_001282680 NM_001282681 NM_015635 NM_001330777 NM_001330778 NM_001354293 NM_001354294 NM_001354295 NM_001354296 NM_001354297 NM_001354298 NM_001354299 NM_001354300 NM_001354301	NM_025709 NM_001356441
RefSeq (білок)	NP_001269608 NP_001269609 NP_001269610 NP_001317706 NP_001317707 NP_056450 NP_001341222 NP_001341223 NP_001341224 NP_001341225 NP_001341226 NP_001341227 NP_001341228 NP_001341229 NP_001341230	NP_079985 NP_001343370
Локус (UCSC)	Хр. 9: 125.26 – 125.37 Mb	Хр. 2: 34.67 – 34.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GAPVD1 (англ. GTPase activating protein and VPS9 domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 478 амінокислот, а молекулярна маса — 164 980.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVKLDIHTLA		HHLKQERLYV		NSEKQLIQRL		NADVLKTAEK		LYRTAWIAKQ
QRINLDRLII		TSAEASPAEC		CQHAKILEDT		QFVDGYKQLG		FQETAYGEFL
SRLRENPRLI		ASSLVAGEKL		NQENTQSVIY		TVFTSLYGNC		IMQEDESYLL
QVLRYLIEFE		LKESDNPRRL		LRRGTCAFSI		LFKLFSEGLF		SAKLFLTATL
HEPIMQLLVE		DEDHLETDPN		KLIERFSPSQ		QEKLFGEKGS		DRFRQKVQEM
VESNEAKLVA		LVNKFIGYLK		QNTYCFPHSL		RWIVSQMYKT		LSCVDRLEVG
EVRAMCTDLL		LACFICPAVV		NPEQYGIISD		APINEVARFN		LMQVGRLLQQ
LAMTGSEEGD		PRTKSSLGKF		DKSCVAAFLD		VVIGGRAVET		PPLSSVNLLE
GLSRTVVYIT		YSQLITLVNF		MKSVMSGDQL		REDRMALDNL		LANLPPAKPG
KSSSLEMTPY		NTPQLSPATT		PANKKNRLPI		ATRSRSRTNM		LMDLHMDHEG
SSQETIQEVQ		PEEVLVISLG		TGPQLTPGMM		SENEVLNMQL		SDGGQGDVPV
DENKLHGKPD		KTLRFSLCSD		NLEGISEGPS		NRSNSVSSLD		LEGESVSELG
AGPSGSNGVE		ALQLLEHEQA		TTQDNLDDKL		RKFEIRDMMG		LTDDRDISET
VSETWSTDVL		GSDFDPNIDE		DRLQEIAGAA		AENMLGSLLC		LPGSGSVLLD
PCTGSTISET		TSEAWSVEVL		PSDSEAPDLK		QEERLQELES		CSGLGSTSDD
TDVREVSSRP		STPGLSVVSG		ISATSEDIPN		KIEDLRSECS		SDFGGKDSVT
SPDMDEITHG		AHQLTSPPSQ		SESLLAMFDP		LSSHEGASAV		VRPKVHYARP
SHPPPDPPIL		EGAVGGNEAR		LPNFGSHVLT		PAEMEAFKQR		HSYPERLVRS
RSSDIVSSVR		RPMSDPSWNR		RPGNEERELP		PAAAIGATSL		VAAPHSSSSS
PSKDSSRGET		EERKDSDDEK		SDRNRPWWRK		RFVSAMPKAP		IPFRKKEKQE
KDKDDLGPDR		FSTLTDDPSP		RLSAQAQVAE		DILDKYRNAI		KRTSPSDGAM
ANYESTGDNH		DRDLSSKLLY		HSDKEVMGDG		ESAHDSPRDE		ALQNISADDL
PDSASQAAHP		QDSAFSYRDA		KKKLRLALCS		ADSVAFPVLT		HSTRNGLPDH
TDPEDNEIVC		FLKVQIAEAI		NLQDKNLMAQ		LQETMRCVCR		FDNRTCRKLL
ASIAEDYRKR		APYIAYLTRC		RQGLQTTQAH		LERLLQRVLR		DKEVANRYFT
TVCVRLLLES		KEKKIREFIQ		DFQKLTAADD		KTAQVEDFLQ		FLYGAMAQDV
IWQNASEEQL		QDAQLAIERS		VMNRIFKLAF		YPNQDGDILR		DQVLHEHIQR
LSKVVTANHR		ALQIPEVYLR		EAPWPSAQSE		IRTISAYKTP		RDKVQCILRM
CSTIMNLLSL		ANEDSVPGAD		DFVPVLVFVL		IKANPPCLLS		TVQYISSFYA
SCLSGEESYW		WMQFTAAVEF		IKTIDDRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 9