GBP1

GBP1
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DG3, 1F5N, 2B8W, 2B92, 2BC9, 2D4H
Ідентифікатори
Символи	GBP1, guanylate binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600411 HomoloGene: 133759 GeneCards: GBP1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • Hsp90 protein binding • spectrin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • actin binding • hydrolase activity • GO:0019974 cytokine binding • GO:0006184 GTPase activity • GTP binding • GDP binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • гіалоплазма • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • extracellular region • цитоплазма • комплекс Ґольджі • vesicle membrane • actin cytoskeleton • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • negative regulation of T cell receptor signaling pathway • negative regulation of protein localization to plasma membrane • defense response to virus • regulation of calcium-mediated signaling • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • regulation of protein localization to plasma membrane • protein homooligomerization • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • protein localization to vacuole Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2633	304266
Ensembl	ENSG00000117228	ENSRNOG00000023943
UniProt	P32455	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_002053	XM_006224278 XM_006233425 XM_008761538 XM_017591353
RefSeq (білок)	NP_002044	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 89.05 – 89.07 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GBP1 (англ. Guanylate binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 67 931.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASEIHMTGP		MCLIENTNGR		LMANPEALKI		LSAITQPMVV		VAIVGLYRTG
KSYLMNKLAG		KKKGFSLGST		VQSHTKGIWM		WCVPHPKKPG		HILVLLDTEG
LGDVEKGDNQ		NDSWIFALAV		LLSSTFVYNS		IGTINQQAMD		QLYYVTELTH
RIRSKSSPDE		NENEVEDSAD		FVSFFPDFVW		TLRDFSLDLE		ADGQPLTPDE
YLTYSLKLKK		GTSQKDETFN		LPRLCIRKFF		PKKKCFVFDR		PVHRRKLAQL
EKLQDEELDP		EFVQQVADFC		SYIFSNSKTK		TLSGGIQVNG		PRLESLVLTY
VNAISSGDLP		CMENAVLALA		QIENSAAVQK		AIAHYEQQMG		QKVQLPTETL
QELLDLHRDS		EREAIEVFIR		SSFKDVDHLF		QKELAAQLEK		KRDDFCKQNQ
EASSDRCSAL		LQVIFSPLEE		EVKAGIYSKP		GGYRLFVQKL		QDLKKKYYEE
PRKGIQAEEI		LQTYLKSKES		MTDAILQTDQ		TLTEKEKEIE		VERVKAESAQ
ASAKMLQEMQ		RKNEQMMEQK		ERSYQEHLKQ		LTEKMENDRV		QLLKEQERTL
ALKLQEQEQL		LKEGFQKESR		IMKNEIQDLQ		TKMRRRKACT		IS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, антивірусний захист, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі. Також секретований назовні.

Література

• Cheng Y.-S.E., Patterson C.E., Staeheli P. (1991). Interferon-induced guanylate-binding proteins lack an N(T)KXD consensus motif and bind GMP in addition to GDP and GTP. Mol. Cell. Biol. 11: 4717—4725. PMID 1715024 DOI:10.1128/MCB.11.9.4717
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Modiano N., Lu Y.E., Cresswell P. (2005). Golgi targeting of human guanylate-binding protein-1 requires nucleotide binding, isoprenylation, and an IFN-gamma-inducible cofactor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 8680—8685. PMID 15937107 DOI:10.1073/pnas.0503227102
• Nordmann A., Wixler L., Boergeling Y., Wixler V., Ludwig S. (2012). A new splice variant of the human guanylate-binding protein 3 mediates anti-influenza activity through inhibition of viral transcription and replication. FASEB J. 26: 1290—1300. PMID 22106366 DOI:10.1096/fj.11-189886
• Prakash B., Praefcke G.J.K., Renault L., Wittinghofer A., Herrmann C. (2000). Structure of human guanylate-binding protein 1 representing a unique class of GTP-binding proteins. Nature. 403: 567—571. PMID 10676968 DOI:10.1038/35000617
• Prakash B., Renault L., Praefcke G.J., Herrmann C., Wittinghofer A. (2000). Triphosphate structure of guanylate-binding protein 1 and implications for nucleotide binding and GTPase mechanism. EMBO J. 19: 4555—4564. PMID 10970849 DOI:10.1093/emboj/19.17.4555

Див. також

• Хромосома 1