GCC2

GCC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BBP
Ідентифікатори
Символи	GCC2, GCC185, RANBP2L4, REN53, GRIP and coiled-coil domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612711 MGI: 1917547 HomoloGene: 45639 GeneCards: GCC2
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • trans-Golgi network • комплекс Ґольджі • мембрана • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • Golgi to plasma membrane protein transport • protein transport • microtubule anchoring • protein targeting to lysosome • retrograde transport, endosome to Golgi • late endosome to Golgi transport • regulation of protein exit from endoplasmic reticulum • microtubule organizing center organization • recycling endosome to Golgi transport • Golgi ribbon formation • protein localization to Golgi apparatus • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9648	70297
Ensembl	ENSG00000135968	ENSMUSG00000038039
UniProt	Q8IWJ2	Q8CHG3
RefSeq (мРНК)	NM_181453	NM_027375
RefSeq (білок)	NP_852118	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 108.45 – 108.51 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GCC2 (англ. GRIP and coiled-coil domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 684 амінокислот, а молекулярна маса — 195 910.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDLVQDGVA		SPATPGTGKS		KLETLPKEDL		IKFAKKQMML		IQKAKSRCTE
LEKEIEELRS		KPVTEGTGDI		IKALTERLDA		LLLEKAETEQ		QCLSLKKENI
KMKQEVEDSV		TKMGDAHKEL		EQSHINYVKE		IENLKNELMA		VRSKYSEDKA
NLQKQLEEAM		NTQLELSEQL		KFQNNSEDNV		KKLQEEIEKI		RPGFEEQILY
LQKQLDATTD		EKKETVTQLQ		NIIEANSQHY		QKNINSLQEE		LLQLKAIHQE
EVKELMCQIE		ASAKEHEAEI		NKLNELKENL		VKQCEASEKN		IQKKYECELE
NLRKATSNAN		QDNQICSILL		QENTFVEQVV		NEKVKHLEDT		LKELESQHSI
LKDEVTYMNN		LKLKLEMDAQ		HIKDEFFHER		EDLEFKINEL		LLAKEEQGCV
IEKLKSELAG		LNKQFCYTVE		QHNREVQSLK		EQHQKEISEL		NETFLSDSEK
EKLTLMFEIQ		GLKEQCENLQ		QEKQEAILNY		ESLREIMEIL		QTELGESAGK
ISQEFESMKQ		QQASDVHELQ		QKLRTAFTEK		DALLETVNRL		QGENEKLLSQ
QELVPELENT		IKNLQEKNGV		YLLSLSQRDT		MLKELEGKIN		SLTEEKDDFI
NKLKNSHEEM		DNFHKKCERE		ERLILELGKK		VEQTIQYNSE		LEQKVNELTG
GLEETLKEKD		QNDQKLEKLM		VQMKVLSEDK		EVLSAEVKSL		YEENNKLSSE
KKQLSRDLEV		FLSQKEDVIL		KEHITQLEKK		LQLMVEEQDN		LNKLLENEQV
QKLFVKTQLY		GFLKEMGSEV		SEDSEEKDVV		NVLQAVGESL		AKINEEKCNL
AFQRDEKVLE		LEKEIKCLQE		ESVVQCEELK		SLLRDYEQEK		VLLRKELEEI
QSEKEALQSD		LLEMKNANEK		TRLENQNLLI		QVEEVSQTCS		KSEIHNEKEK
CFIKEHENLK		PLLEQKELRD		RRAELILLKD		SLAKSPSVKN		DPLSSVKELE
EKIENLEKEC		KEKEEKINKI		KLVAVKAKKE		LDSSRKETQT		VKEELESLRS
EKDQLSASMR		DLIQGAESYK		NLLLEYEKQS		EQLDVEKERA		NNFEHRIEDL
TRQLRNSTLQ		CETINSDNED		LLARIETLQS		NAKLLEVQIL		EVQRAKAMVD
KELEAEKLQK		EQKIKEHATT		VNELEELQVQ		LQKQKKQLQK		TMQELELVKK
DAQQTTLMNM		EIADYERLMK		ELNQKLTNKN		NKIEDLEQEI		KIQKQKQETL
QEEITSLQSS		VQQYEEKNTK		IKQLLVKTKK		ELADSKQAET		DHLILQASLK
GELEASQQQV		EVYKIQLAEI		TSEKHKIHEH		LKTSAEQHQR		TLSAYQQRVT
ALQEECRAAK		AEQATVTSEF		ESYKVRVHNV		LKQQKNKSMS		QAETEGAKQE
REHLEMLIDQ		LKIKLQDSQN		NLQINVSELQ		TLQSEHDTLL		ERHNKMLQET
VSKEAELREK		LCSIQSENMM		MKSEHTQTVS		QLTSQNEVLR		NSFRDQVRHL
QEEHRKTVET		LQQQLSKMEA		QLFQLKNEPT		TRSPVSSQQS		LKNLRERRNT
DLPLLDMHTV		TREEGEGMET		TDTESVSSAS		TYTQSLEQLL		NSPETKLEPP
LWHAEFTKEE		LVQKLSSTTK		SADHLNGLLR		ETEATNAILM		EQIKLLKSEI
RRLERNQERE		KSAANLEYLK		NVLLQFIFLK		PGSERERLLP		VINTMLQLSP
EEKGKLAAVA		QGEEENASRS		SGWASYLHSW		SGLR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Luke M.R., Kjer-Nielsen L., Brown D.L., Stow J.L., Gleeson P.A. (2003). GRIP domain-mediated targeting of two new coiled-coil proteins, GCC88 and GCC185, to subcompartments of the trans-Golgi network. J. Biol. Chem. 278: 4216—4226. PMID 12446665 DOI:10.1074/jbc.M210387200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Ganley I.G., Espinosa E., Pfeffer S.R. (2008). A syntaxin 10-SNARE complex distinguishes two distinct transport routes from endosomes to the trans-Golgi in human cells. J. Cell Biol. 180: 159—172. PMID 18195106 DOI:10.1083/jcb.200707136
• Houghton F.J., Chew P.L., Lodeho S., Goud B., Gleeson P.A. (2009). The localization of the Golgin GCC185 is independent of Rab6A/A' and Arl1. Cell. 138: 787—794. PMID 19703403 DOI:10.1016/j.cell.2009.05.048
• Burguete A.S., Fenn T.D., Brunger A.T., Pfeffer S.R. (2008). Rab and Arl GTPase family members cooperate in the localization of the golgin GCC185. Cell. 132: 286—298. PMID 18243103 DOI:10.1016/j.cell.2007.11.048

Див. також

• Хромосома 2