GDAP2

GDAP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4UML
Ідентифікатори
Символи	GDAP2, MACROD3, ganglioside induced differentiation associated protein 2, SCAR27
Зовнішні ІД	OMIM: 618128 MGI: 1338001 HomoloGene: 7728 GeneCards: GDAP2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • lysosomal membrane Біологічний процес • response to retinoic acid Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54834	14547
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000027865
UniProt	Q9NXN4	Q9DBL2
RefSeq (мРНК)	NM_001135589 NM_017686	NM_010269
RefSeq (білок)	NP_001129061 NP_060156	NP_034399
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 3: 100.07 – 100.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GDAP2 (англ. Ganglioside induced differentiation associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 497 амінокислот, а молекулярна маса — 56 225.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPLGAPSQF		VDVDTLPSWG		DSCQDELNSS		DTTAEIFQED		TVRSPFLYNK
DVNGKVVLWK		GDVALLNCTA		IVNTSNESLT		DKNPVSESIF		MLAGPDLKED
LQKLKGCRTG		EAKLTKGFNL		AARFIIHTVG		PKYKSRYRTA		AESSLYSCYR
NVLQLAKEQS		MSSVGFCVIN		SAKRGYPLED		ATHIALRTVR		RFLEIHGETI
EKVVFAVSDL		EEGTYQKLLP		LYFPRSLKEE		NRSLPYLPAD		IGNAEGEPVV
PERQIRISEK		PGAPEDNQEE		EDEGLGVDLS		FIGSHAFARM		EGDIDKQRKL
ILQGQLSEAA		LQKQHQRNYN		RWLCQARSED		LSDIASLKAL		YQTGVDNCGR
TVMVVVGRNI		PVTLIDMDKA		LLYFIHVMDH		IAVKEYVLVY		FHTLTSEYNH
LDSDFLKKLY		DVVDVKYKRN		LKAVYFVHPT		FRSKVSTWFF		TTFSVSGLKD
KIHHVDSLHQ		LFSAISPEQI		DFPPFVLEYD		ARENGPYYTS		YPPSPDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1