GDI2

GDI2
Ідентифікатори
Символи	GDI2, HEL-S-46e, RABGDIB, GDP dissociation inhibitor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600767 MGI: 99845 HomoloGene: 37488 GeneCards: GDI2
Онтологія гена Молекулярна функція • Rab GDP-dissociation inhibitor activity • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • small GTPase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP-dissociation inhibitor activity • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • везикула • гіалоплазма • мембрана • focal adhesion • екзосома • extracellular region • secretory granule lumen • azurophil granule lumen • комплекс Ґольджі • синапс Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • protein transport • GO:0048552 regulation of catalytic activity • regulation of small GTPase mediated signal transduction • vesicle-mediated transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • small GTPase mediated signal transduction • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2665	14569
Ensembl	ENSG00000057608	ENSMUSG00000021218
UniProt	P50395 Q5SX91	Q61598
RefSeq (мРНК)	NM_001494 NM_001115156	NM_008112
RefSeq (білок)	NP_001108628 NP_001485	NP_032138
Локус (UCSC)	Хр. 10: 5.77 – 5.84 Mb	Хр. 13: 3.59 – 3.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GDI2 (англ. GDP dissociation inhibitor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 50 663.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNEEYDVIVL		GTGLTECILS		GIMSVNGKKV		LHMDRNPYYG		GESASITPLE
DLYKRFKIPG		SPPESMGRGR		DWNVDLIPKF		LMANGQLVKM		LLYTEVTRYL
DFKVTEGSFV		YKGGKIYKVP		STEAEALASS		LMGLFEKRRF		RKFLVYVANF
DEKDPRTFEG		IDPKKTTMRD		VYKKFDLGQD		VIDFTGHALA		LYRTDDYLDQ
PCYETINRIK		LYSESLARYG		KSPYLYPLYG		LGELPQGFAR		LSAIYGGTYM
LNKPIEEIIV		QNGKVIGVKS		EGEIARCKQL		ICDPSYVKDR		VEKVGQVIRV
ICILSHPIKN		TNDANSCQII		IPQNQVNRKS		DIYVCMISFA		HNVAAQGKYI
AIVSTTVETK		EPEKEIRPAL		ELLEPIEQKF		VSISDLLVPK		DLGTESQIFI
SRTYDATTHF		ETTCDDIKNI		YKRMTGSEFD		FEEMKRKKND		IYGED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• Sedlacek Z., Munstermann E., Mincheva A., Lichter P., Poutska A. (1998). The human rab GDI beta gene with long retroposon-rich introns maps to 10p15 and its pseudogene to 7p11-p13. Mamm. Genome. 9: 78—80. PMID 9434952 DOI:10.1007/s003359900685
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Caillol N., Pasqualini E., Lloubes R., Lombardo D. (2000). Impairment of bile salt-dependent lipase secretion in human pancreatic tumoral SOJ-6 cells. J. Cell. Biochem. 79: 628—647. PMID 10996854 DOI:10.1002/1097-4644(20001215)79:4<628::AID-JCB120>3.0.CO;2-T
• Bachner D., Sedlacek Z., Korn B., Hameister H., Poustka A. (1995). Expression patterns of two human genes coding for different rab GDP-dissociation inhibitors (GDIs), extremely conserved proteins involved in cellular transport. Hum. Mol. Genet. 4: 701—708. PMID 7543319 DOI:10.1093/hmg/4.4.701

Див. також

• Хромосома 10