GDPD5

GDPD5
Ідентифікатори
Символи	GDPD5, GDE2, PP1665, glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5
Зовнішні ІД	OMIM: 609632 MGI: 2686926 HomoloGene: 32741 GeneCards: GDPD5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • glycerophosphocholine phosphodiesterase activity • phosphoric diester hydrolase activity • glycerophosphodiester phosphodiesterase activity • hydrolase activity • phosphatidylinositol phospholipase C activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • cell projection • мембрана • growth cone • perinuclear endoplasmic reticulum • аксон • neuronal cell body • perinuclear region of cytoplasm • система ендомембран Біологічний процес • regulation of timing of cell differentiation • lipid metabolism • нейробіологія розвитку • positive regulation of cell cycle • positive regulation of neuron differentiation • cerebral cortex neuron differentiation • spinal cord motor neuron differentiation • neuron projection development • negative regulation of Notch signaling pathway • обмін речовин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81544	233552
Ensembl	ENSG00000158555	ENSMUSG00000035314
UniProt	Q8WTR4	Q640M6
RefSeq (мРНК)	NM_030792 NM_001351167 NM_001351168	NM_201352 NM_001362166 NM_001362167 NM_001362168
RefSeq (білок)	NP_110419 NP_001338096 NP_001338097	NP_958740 NP_001349095 NP_001349096 NP_001349097
Локус (UCSC)	Хр. 11: 75.43 – 75.53 Mb	Хр. 7: 99.03 – 99.11 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GDPD5 (англ. Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 68 586.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRHQPLQYY		EPQLCLSCLT		GIYGCRWKRY		QRSHDDTTPW		ERLWFLLLTF
TFGLTLTWLY		FWWEVHNDYD		EFNWYLYNRM		GYWSDWPVPI		LVTTAAAFAY
IAGLLVLALC		HIAVGQQMNL		HWLHKIGLVV		ILASTVVAMS		AVAQLWEDEW
EVLLISLQGT		APFLHVGAVA		AVTMLSWIVA		GQFARAERTS		SQVTILCTFF
TVVFALYLAP		LTISSPCIME		KKDLGPKPAL		IGHRGAPMLA		PEHTLMSFRK
ALEQKLYGLQ		ADITISLDGV		PFLMHDTTLR		RTTNVEEEFP		ELARRPASML
NWTTLQRLNA		GQWFLKTDPF		WTASSLSPSD		HREAQNQSIC		SLAELLELAK
GNATLLLNLR		DPPREHPYRS		SFINVTLEAV		LHSGFPQHQV		MWLPSRQRPL
VRKVAPGFQQ		TSGSKEAVAS		LRRGHIQRLN		LRYTQVSRQE		LRDYASWNLS
VNLYTVNAPW		LFSLLWCAGV		PSVTSDNSHA		LSQVPSPLWI		MPPDEYCLMW
VTADLVSFTL		IVGIFVLQKW		RLGGIRSYNP		EQIMLSAAVR		RTSRDVSIMK
EKLIFSEISD		GVEVSDVLSV		CSDNSYDTYA		NSTATPVGPR		GGGSHTKTLI
ERSGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11