GGA1

GGA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1J2J, 1JWF, 1JWG, 1NA8, 1NAF, 1NWM, 1O3X, 1OM9, 1OXZ, 1PY1, 1UJJ, 1UJK, 1X79, 2DWX, 2DWY, 3G2S, 3G2T, 3G2U, 3G2V, 3G2W
Ідентифікатори
Символи	GGA1, golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606004 MGI: 2146207 HomoloGene: 39250 GeneCards: GGA1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • молекулярна функція Клітинна компонента • ендосома • комплекс Ґольджі • endosome membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • clathrin adaptor complex • нуклеоплазма • early endosome membrane • early endosome • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • protein transport • intracellular protein transport • toxin transport • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle-mediated transport • GO:0015915 транспорт • Golgi to plasma membrane transport • GO:0034613 protein localization • protein localization to cell surface • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi to plasma membrane protein transport • protein localization to ciliary membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26088	106039
Ensembl	ENSG00000100083	ENSMUSG00000033128
UniProt	Q9UJY5	Q8R0H9
RefSeq (мРНК)	NM_001001560 NM_001001561 NM_001172687 NM_001172688 NM_013365 NM_001363771	NM_145929
RefSeq (білок)	NP_001001560 NP_001166158 NP_001166159 NP_037497 NP_001350700	NP_666041
Локус (UCSC)	Хр. 22: 37.61 – 37.63 Mb	Хр. 15: 78.76 – 78.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GGA1 (англ. Golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 639 амінокислот, а молекулярна маса — 70 384.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPAMEPETL		EARINRATNP		LNKELDWASI		NGFCEQLNED		FEGPPLATRL
LAHKIQSPQE		WEAIQALTVL		ETCMKSCGKR		FHDEVGKFRF		LNELIKVVSP
KYLGSRTSEK		VKNKILELLY		SWTVGLPEEV		KIAEAYQMLK		KQGIVKSDPK
LPDDTTFPLP		PPRPKNVIFE		DEEKSKMLAR		LLKSSHPEDL		RAANKLIKEM
VQEDQKRMEK		ISKRVNAIEE		VNNNVKLLTE		MVMSHSQGGA		AAGSSEDLMK
ELYQRCERMR		PTLFRLASDT		EDNDEALAEI		LQANDNLTQV		INLYKQLVRG
EEVNGDATAG		SIPGSTSALL		DLSGLDLPPA		GTTYPAMPTR		PGEQASPEQP
SASVSLLDDE		LMSLGLSDPT		PPSGPSLDGT		GWNSFQSSDA		TEPPAPALAQ
APSMESRPPA		QTSLPASSGL		DDLDLLGKTL		LQQSLPPESQ		QVRWEKQQPT
PRLTLRDLQN		KSSSCSSPSS		SATSLLHTVS		PEPPRPPQQP		VPTELSLASI
TVPLESIKPS		NILPVTVYDQ		HGFRILFHFA		RDPLPGRSDV		LVVVVSMLST
APQPIRNIVF		QSAVPKVMKV		KLQPPSGTEL		PAFNPIVHPS		AITQVLLLAN
PQKEKVRLRY		KLTFTMGDQT		YNEMGDVDQF		PPPETWGSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Boman A.L., Zhang C.-J., Zhu X., Kahn R.A. (2000). A family of ADP-ribosylation factor effectors that can alter transport through the trans-Golgi. Mol. Biol. Cell. 11: 1241—1255. PMID 10749927 DOI:10.1091/mbc.11.4.1241
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takatsu H., Yoshino K., Nakayama K. (2000). Adaptor gamma ear homology domain conserved in gamma-adaptin and GGA proteins that interact with gamma-synergin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271: 719—725. PMID 10814529 DOI:10.1006/bbrc.2000.2700
• Puertollano R., Randazzo P.A., Presley J.F., Hartnell L.M., Bonifacino J.S. (2001). The GGAs promote ARF-dependent recruitment of clathrin to the TGN. Cell. 105: 93—102. PMID 11301005 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00299-9
• Takatsu H., Katoh Y., Shiba Y., Nakayama K. (2001). Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology domain, ADP-ribosylation factor-binding (GGA) proteins interact with acidic dileucine sequences within the cytoplasmic domains of sorting receptors through their Vps27p/Hrs/STAM (VHS) domains. J. Biol. Chem. 276: 28541—28545. PMID 11390366 DOI:10.1074/jbc.C100218200
• Puertollano R., Aguilar R.C., Gorshkova I., Crouch R.J., Bonifacino J.S. (2001). Sorting of mannose 6-phosphate receptors mediated by the GGAs. Science. 292: 1712—1716. PMID 11387475 DOI:10.1126/science.1060750

Див. також

• Хромосома 22