GGA3

GGA3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JPL, 1JUQ, 1LF8, 1P4U, 1WR6, 1YD8
Ідентифікатори
Символи	GGA3, golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606006 MGI: 2384159 HomoloGene: 121703 GeneCards: GGA3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin binding Клітинна компонента • ендосома • trans-Golgi network • endosome membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • clathrin adaptor complex • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • recycling endosome membrane • early endosome • recycling endosome Біологічний процес • protein transport • intracellular protein transport • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • vesicle-mediated transport • protein localization to lysosome • regulation of protein stability • protein destabilization • endocytic recycling • protein localization to cell surface • Golgi to plasma membrane protein transport • negative regulation of amyloid-beta formation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23163	260302
Ensembl	ENSG00000125447	ENSMUSG00000020740
UniProt	Q9NZ52	Q8BMI3
RefSeq (мРНК)	NM_001172703 NM_001172704 NM_001291641 NM_001291642 NM_014001 NM_138619	NM_001252067 NM_173048
RefSeq (білок)	NP_001166174 NP_001166175 NP_001278570 NP_001278571 NP_054720 NP_619525	NP_001238996 NP_766636
Локус (UCSC)	Хр. 17: 75.24 – 75.26 Mb	Хр. 11: 115.48 – 115.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GGA3 (англ. Golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 723 амінокислот, а молекулярна маса — 78 315.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAEGESLE		SWLNKATNPS		NRQEDWEYII		GFCDQINKEL		EGPQIAVRLL
AHKIQSPQEW		EALQALTVLE		ACMKNCGRRF		HNEVGKFRFL		NELIKVVSPK
YLGDRVSEKV		KTKVIELLYS		WTMALPEEAK		IKDAYHMLKR		QGIVQSDPPI
PVDRTLIPSP		PPRPKNPVFD		DEEKSKLLAK		LLKSKNPDDL		QEANKLIKSM
VKEDEARIQK		VTKRLHTLEE		VNNNVRLLSE		MLLHYSQEDS		SDGDRELMKE
LFDQCENKRR		TLFKLASETE		DNDNSLGDIL		QASDNLSRVI		NSYKTIIEGQ
VINGEVATLT		LPDSEGNSQC		SNQGTLIDLA		ELDTTNSLSS		VLAPAPTPPS
SGIPILPPPP		QASGPPRSRS		SSQAEATLGP		SSTSNALSWL		DEELLCLGLA
DPAPNVPPKE		SAGNSQWHLL		QREQSDLDFF		SPRPGTAACG		ASDAPLLQPS
APSSSSSQAP		LPPPFPAPVV		PASVPAPSAG		SSLFSTGVAP		ALAPKVEPAV
PGHHGLALGN		SALHHLDALD		QLLEEAKVTS		GLVKPTTSPL		IPTTTPARPL
LPFSTGPGSP		LFQPLSFQSQ		GSPPKGPELS		LASIHVPLES		IKPSSALPVT
AYDKNGFRIL		FHFAKECPPG		RPDVLVVVVS		MLNTAPLPVK		SIVLQAAVPK
SMKVKLQPPS		GTELSPFSPI		QPPAAITQVM		LLANPLKEKV		RLRYKLTFAL
GEQLSTEVGE		VDQFPPVEQW		GNL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Boman A.L., Zhang C.-J., Zhu X., Kahn R.A. (2000). A family of ADP-ribosylation factor effectors that can alter transport through the trans-Golgi. Mol. Biol. Cell. 11: 1241—1255. PMID 10749927 DOI:10.1091/mbc.11.4.1241
• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takatsu H., Yoshino K., Nakayama K. (2000). Adaptor gamma ear homology domain conserved in gamma-adaptin and GGA proteins that interact with gamma-synergin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271: 719—725. PMID 10814529 DOI:10.1006/bbrc.2000.2700
• Puertollano R., Randazzo P.A., Presley J.F., Hartnell L.M., Bonifacino J.S. (2001). The GGAs promote ARF-dependent recruitment of clathrin to the TGN. Cell. 105: 93—102. PMID 11301005 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00299-9
• Puertollano R., Aguilar R.C., Gorshkova I., Crouch R.J., Bonifacino J.S. (2001). Sorting of mannose 6-phosphate receptors mediated by the GGAs. Science. 292: 1712—1716. PMID 11387475 DOI:10.1126/science.1060750

Див. також

• Хромосома 17