GMIP

GMIP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QWE
Ідентифікатори
Символи	GMIP, ARHGAP46, GEM interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 609694 MGI: 1926066 HomoloGene: 9570 GeneCards: GMIP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51291	78816
Ensembl	ENSG00000089639	ENSMUSG00000036246
UniProt	Q9P107	Q6PGG2
RefSeq (мРНК)	NM_001288998 NM_001288999 NM_016573	NM_198101
RefSeq (білок)	NP_001275927 NP_001275928 NP_057657	NP_932769
Локус (UCSC)	Хр. 19: 19.63 – 19.64 Mb	Хр. 8: 70.26 – 70.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GMIP (англ. GEM interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 970 амінокислот, а молекулярна маса — 106 683.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAAEPGLPP		GPEGRKRYSD		IFRSLDNLEI		SLGNVTLEML		AGDPLLSEDP
EPDKTPTATV		TNEASCWSGP		SPEGPVPLTG		EELDLRLIRT		KGGVDAALEY
AKTWSRYAKE		LLAWTEKRAS		YELEFAKSTM		KIAEAGKVSI		QQQSHMPLQY
IYTLFLEHDL		SLGTLAMETV		AQQKRDYYQP		LAAKRTEIEK		WRKEFKEQWM
KEQKRMNEAV		QALRRAQLQY		VQRSEDLRAR		SQGSPEDSAP		QASPGPSKQQ
ERRRRSREEA		QAKAQEAEAL		YQACVREANA		RQQDLEIAKQ		RIVSHVRKLV
FQGDEVLRRV		TLSLFGLRGA		QAERGPRAFA		ALAECCAPFE		PGQRYQEFVR
ALRPEAPPPP		PPAFSFQEFL		PSLNSSPLDI		RKKLSGPLPP		RLDENSAEPG
PWEDPGTGWR		WQGTPGPTPG		SDVDSVGGGS		ESRSLDSPTS		SPGAGTRQLV
KASSTGTESS		DDFEERDPDL		GDGLENGLGS		PFGKWTLSSA		AQTHQLRRLR
GPAKCRECEA		FMVSGTECEE		CFLTCHKRCL		ETLLILCGHR		RLPARTPLFG
VDFLQLPRDF		PEEVPFVVTK		CTAEIEHRAL		DVQGIYRVSG		SRVRVERLCQ
AFENGRALVE		LSGNSPHDVS		SVLKRFLQEL		TEPVIPFHLY		DAFISLAKTL
HADPGDDPGT		PSPSPEVIRS		LKTLLVQLPD		SNYNTLRHLV		AHLFRVAARF
MENKMSANNL		GIVFGPTLLR		PPDGPRAASA		IPVTCLLDSG		HQAQLVEFLI
VHYEQIFGMD		ELPQATEPPP		QDSSPAPGPL		TTSSQPPPPH		LDPDSQPPVL
ASDPGPDPQH		HSTLEQHPTA		TPTEIPTPQS		DQREDVAEDT		KDGGGEVSSQ
GPEDSLLGTQ		SRGHFSRQPV		KYPRGGVRPV		THQLSSLALV		ASKLCEETPI
TSVPRGSLRG		RGPSPAAASP		EGSPLRRTPL		PKHFEITQET		ARLLSKLDSE
AVPRATCCPD		VQPEEAEDHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Aresta S., de Tand-Heim M.-F., Beranger F., de Gunzburg J. (2002). A novel Rho GTPase-activating-protein interacts with Gem, a member of the Ras superfamily of GTPases. Biochem. J. 367: 57—65. PMID 12093360 DOI:10.1042/BJ20020829
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 19