GOPC

GOPC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DC2, 2LOB, 4E34, 4E35, 4JOE, 4JOF, 4JOG, 4JOH, 4JOJ, 4JOK, 4JOP, 4JOR, 4K6Y, 4K72, 4K75, 4K76, 4K78, 4NMO, 4NMP, 4NMQ, 4NMR, 4NMS, 4NMT, 4NMV, 4Q6H, 4Q6S
Ідентифікатори
Символи	GOPC, CAL, FIG, GOPC1, PIST, dJ94G16.2, golgi-associated PDZ and coiled-coil motif containing, golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing
Зовнішні ІД	OMIM: 606845 MGI: 2149946 HomoloGene: 10695 GeneCards: GOPC
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane transporter binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005110 frizzled binding • protein C-terminus binding • GO:0005083 GTPase regulator activity • protein homodimerization activity Клітинна компонента • lysosomal membrane • Golgi-associated vesicle membrane • trans-Golgi network transport vesicle • синапс • cell projection • Міжклітинні контакти • Golgi membrane • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення • postsynaptic membrane • дендрит (нейробіологія) • мембрана • комплекс Ґольджі • цитоплазма • клітинна мембрана • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • protein homooligomerization • apical protein localization • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • negative regulation of anion channel activity • cytoplasmic sequestering of CFTR protein • negative regulation of protein localization to cell surface • spermatid nucleus differentiation • GO:0048552 regulation of catalytic activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57120	94221
Ensembl	ENSG00000047932	ENSMUSG00000019861
UniProt	Q9HD26	Q8BH60
RefSeq (мРНК)	NM_020399 NM_001017408	NM_001199272 NM_053187
RefSeq (білок)	NP_001017408 NP_065132	NP_001186201 NP_444417
Локус (UCSC)	Хр. 6: 117.56 – 117.6 Mb	Хр. 10: 52.21 – 52.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GOPC (англ. Golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 50 520.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAGGPCPAA		AGGGPGGASC		SVGAPGGVSM		FRWLEVLEKE		FDKAFVDVDL
LLGEIDPDQA		DITYEGRQKM		TSLSSCFAQL		CHKAQSVSQI		NHKLEAQLVD
LKSELTETQA		EKVVLEKEVH		DQLLQLHSIQ		LQLHAKTGQS		ADSGTIKAKL
SGPSVEELER		ELEANKKEKM		KEAQLEAEVK		LLRKENEALR		RHIAVLQAEV
YGARLAAKYL		DKELAGRVQQ		IQLLGRDMKG		PAHDKLWNQL		EAEIHLHRHK
TVIRACRGRN		DLKRPMQAPP		GHDQDSLKKS		QGVGPIRKVL		LLKEDHEGLG
ISITGGKEHG		VPILISEIHP		GQPADRCGGL		HVGDAILAVN		GVNLRDTKHK
EAVTILSQQR		GEIEFEVVYV		APEVDSDDEN		VEYEDESGHR		YRLYLDELEG
GGNPGASCKD		TSGEIKVLQG		FNKKAVTDTH		ENGDLGTASE		TPLDDGASKL
DDLHTLYHKK		SY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, апараті гольджі, синапсах.

Література

• Neudauer C.L., Joberty G., Macara I.G. (2001). PIST: a novel PDZ/coiled-coil domain binding partner for the rho-family GTPase TC10. Biochem. Biophys. Res. Commun. 280: 541—547. PMID 11162552 DOI:10.1006/bbrc.2000.4160
• Charest A., Lane K., McMahon K., Housman D.E. (2001). Association of a novel PDZ domain-containing peripheral Golgi protein with the Q-SNARE (Q-soluble N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein (NSF) attachment protein receptor) protein syntaxin 6. J. Biol. Chem. 276: 29456—29465. PMID 11384996 DOI:10.1074/jbc.M104137200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cheng J., Wang H., Guggino W.B. (2004). Modulation of mature cystic fibrosis transmembrane regulator protein by the PDZ domain protein CAL. J. Biol. Chem. 279: 1892—1898. PMID 14570915 DOI:10.1074/jbc.M308640200
• Hruska-Hageman A.M., Benson C.J., Leonard A.S., Price M.P., Welsh M.J. (2004). PSD-95 and Lin-7b interact with acid-sensing ion channel-3 and have opposite effects on H+- gated current. J. Biol. Chem. 279: 46962—46968. PMID 15317815 DOI:10.1074/jbc.M405874200
• He J., Bellini M., Xu J., Castleberry A.M., Hall R.A. (2004). Interaction with cystic fibrosis transmembrane conductance regulator-associated ligand (CAL) inhibits beta1-adrenergic receptor surface expression. J. Biol. Chem. 279: 50190—50196. PMID 15358775 DOI:10.1074/jbc.M404876200

Див. також

• Хромосома 6