GPD1

GPD1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WPQ, 1X0V, 1X0X
Ідентифікатори
Символи	GPD1, GPD-C, GPDH-C, HTGTI, glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 138420 MGI: 95679 HomoloGene: 5593 GeneCards: GPD1
Пов'язані генетичні захворювання
	transient infantile hypertriglyceridemia and hepatosteatosis
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor; • protein homodimerization activity; • NAD binding; • glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD+ activity]; • oxidoreductase activity; • glycerol-3-phosphate dehydrogenase (quinone) activity; • GO:0036439 glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(P)+ activity];
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • glycerol-3-phosphate dehydrogenase complex; • мітохондрія; • екзосома;
Біологічний процес	• phosphatidic acid biosynthetic process; • glycerolipid metabolic process; • глюконеогенез; • glycerol-3-phosphate catabolic process; • cellular response to tumor necrosis factor; • glycerol-3-phosphate metabolic process; • NADH metabolic process; • NADH oxidation; • glycerophosphate shuttle; • positive regulation of glycolytic process; • cellular response to cAMP; • carbohydrate metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2819
	14555
	ENSG00000167588
	ENSMUSG00000023019
	P21695
	P13707
	NM_005276; NM_001257199
	NM_010271
	NP_001244128; NP_005267
	NP_034401
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GPD1 (англ. Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 349 амінокислот, а молекулярна маса — 37 568^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASKKVCIVG	SGNWGSAIAK	IVGGNAAQLA	QFDPRVTMWV	FEEDIGGKKL
TEIINTQHEN	VKYLPGHKLP	PNVVAVPDVV	QAAEDADILI	FVVPHQFIGK
ICDQLKGHLK	ANATGISLIK	GVDEGPNGLK	LISEVIGERL	GIPMSVLMGA
NIASEVADEK	FCETTIGCKD	PAQGQLLKEL	MQTPNFRITV	VQEVDTVEIC
GALKNVVAVG	AGFCDGLGFG	DNTKAAVIRL	GLMEMIAFAK	LFCSGPVSSA
TFLESCGVAD	LITTCYGGRN	RKVAEAFART	GKSIEQLEKE	LLNGQKLQGP
ETARELYSIL	QHKGLVDKFP	LFMAVYKVCY	EGQPVGEFIH	CLQNHPEHM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Menaya J., Gonzalez-Manchon C., Parrilla R., Ayuso M.S. (1995). Molecular cloning, sequencing and expression of a cDNA encoding a human liver NAD-dependent alpha-glycerol-3-phosphate dehydrogenase. Biochim. Biophys. Acta. 1262: 91—94. PMID 7772607 DOI:10.1016/0167-4781(95)00069-S
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gwynn B., Lyford K.L., Birkenmeier E.H. (1990). Sequence conservation and structural organization of the glycerol-3-phosphate dehydrogenase promoter in mice and humans. Mol. Cell. Biol. 10: 5244—5256. PMID 2398890 DOI:10.1128/MCB.10.10.5244