GREM1

GREM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5AEJ
Ідентифікатори
Символи	GREM1, CKTSF1B1, CRAC1, DAND2, DRM, GREMLIN, HMPS, IHG-2, C15DUPq, CRCS4, DUP15q, HMPS1, MPSH, PIG2, gremlin 1, DAN family BMP antagonist
Зовнішні ІД	OMIM: 603054 MGI: 1344337 HomoloGene: 8022 GeneCards: GREM1
Онтологія гена Молекулярна функція • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding • receptor ligand activity • cytokine activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • morphogen activity • BMP binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір • внутрішньоклітинний • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • signal transduction by p53 class mediator • proximal/distal pattern formation • negative regulation of bone mineralization • positive regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • positive regulation of receptor internalization • collagen fibril organization • cell-cell signaling • regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of protein tyrosine kinase activity • mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • cell migration involved in sprouting angiogenesis • positive regulation of angiogenesis • limb development • negative regulation of BMP signaling pathway • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of bone mineralization involved in bone maturation • positive regulation of signaling receptor activity • branching involved in ureteric bud morphogenesis • determination of dorsal identity • negative regulation of chondrocyte differentiation • negative regulation of monocyte chemotaxis • embryonic limb morphogenesis • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of cell growth • positive regulation of telomerase activity • GO:0000767 cell morphogenesis • positive regulation of cell population proliferation • Ангіогенез • ureteric bud formation • positive regulation of peptidyl-tyrosine autophosphorylation • regulation of focal adhesion assembly • negative regulation of osteoclast proliferation • animal organ morphogenesis • negative regulation of osteoblast proliferation • negative regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis • positive regulation of cardiac muscle cell differentiation • activation of transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of leukocyte chemotaxis • negative regulation of bone remodeling • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of bone trabecula formation • endothelial cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of stress-activated MAPK cascade • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of osteoblast differentiation • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26585	23892
Ensembl	ENSG00000282046 ENSG00000276886 ENSG00000166923	ENSMUSG00000074934
UniProt	O60565	O70326
RefSeq (мРНК)	NM_001191322 NM_001191323 NM_013372 NM_001368719	NM_011824
RefSeq (білок)	NP_001178251 NP_001178252 NP_037504 NP_001355648	NP_035954
Локус (UCSC)	Хр. 15: 32.72 – 32.75 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GREM1 (англ. Gremlin 1, DAN family BMP antagonist) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 184 амінокислот, а молекулярна маса — 20 697.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRTAYTVGA		LLLLLGTLLP		AAEGKKKGSQ		GAIPPPDKAQ		HNDSEQTQSP
QQPGSRNRGR		GQGRGTAMPG		EEVLESSQEA		LHVTERKYLK		RDWCKTQPLK
QTIHEEGCNS		RTIINRFCYG		QCNSFYIPRH		IRKEEGSFQS		CSFCKPKKFT
TMMVTLNCPE		LQPPTKKKRV		TRVKQCRCIS		IDLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Hsu D.R., Economides A.N., Wang X., Eimon P.M., Harland R.M. (1998). The Xenopus dorsalizing factor Gremlin identifies a novel family of secreted proteins that antagonize BMP activities. Mol. Cell. 1: 673—683. PMID 9660951 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80067-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Kisonaite M., Wang X., Hyvonen M. (2016). Structure of Gremlin-1 and analysis of its interaction with BMP-2. Biochem. J. 473: 1593—1604. PMID 27036124 DOI:10.1042/BCJ20160254
• Topol L.Z., Modi W.S., Koochekpour S., Blair D.G. (2000). DRM/GREMLIN (CKTSF1B1) maps to human chromosome 15 and is highly expressed in adult and fetal brain. Cytogenet. Cell Genet. 89: 79—84. PMID 10894942

Див. також

• Хромосома 15