GRSF1

GRSF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LMI, 4QU6, 4QU7
Ідентифікатори
Символи	GRSF1, G-rich RNA sequence binding factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604851 MGI: 106479 HomoloGene: 20482 GeneCards: GRSF1
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • ribonucleoprotein granule • mitochondrial nucleoid • мітохондрія Біологічний процес • tRNA processing • anterior/posterior pattern specification • mRNA polyadenylation • morphogenesis of embryonic epithelium • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2926	231413
Ensembl	ENSG00000132463	ENSMUSG00000044221
UniProt	Q12849	Q8C5Q4
RefSeq (мРНК)	NM_001098477 NM_002092	NM_001098476 NM_178700
RefSeq (білок)	NP_001091947 NP_002083	NP_001091946 NP_848815
Локус (UCSC)	Хр. 4: 70.82 – 70.84 Mb	Хр. 5: 88.81 – 88.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GRSF1 (англ. G-rich RNA sequence binding factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 53 126.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGTRWVLGA		LLRGCGCNCS		SCRRTGAACL		PFYSAAGSIP		SGVSGRRRLL
LLLGAAAAAA		SQTRGLQTGP		VPPGRLAGPP		AVATSAAAAA		AASYSALRAS
LLPQSLAAAA		AVPTRSYSQE		SKTTYLEDLP		PPPEYELAPS		KLEEEVDDVF
LIRAQGLPWS		CTMEDVLNFF		SDCRIRNGEN		GIHFLLNRDG		KRRGDALIEM
ESEQDVQKAL		EKHRMYMGQR		YVEVYEINNE		DVDALMKSLQ		VKSSPVVNDG
VVRLRGLPYS		CNEKDIVDFF		AGLNIVDITF		VMDYRGRRKT		GEAYVQFEEP
EMANQALLKH		REEIGNRYIE		IFPSRRNEVR		THVGSYKGKK		IASFPTAKYI
TEPEMVFEEH		EVNEDIQPMT		AFESEKEIEL		PKEVPEKLPE		AADFGTTSSL
HFVHMRGLPF		QANAQDIINF		FAPLKPVRIT		MEYSSSGKAT		GEADVHFETH
EDAVAAMLKD		RSHVHHRYIE		LFLNSCPKGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, процесинг тРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

• Qian Z., Wilusz J. (1994). GRSF-1: a poly(A)+ mRNA binding protein which interacts with a conserved G-rich element. Nucleic Acids Res. 22: 2334—2343. PMID 8036161 DOI:10.1093/nar/22.12.2334
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Antonicka H., Sasarman F., Nishimura T., Paupe V., Shoubridge E.A. (2013). The mitochondrial RNA-binding protein GRSF1 localizes to RNA granules and is required for posttranscriptional mitochondrial gene expression. Cell Metab. 17: 386—398. PMID 23473033 DOI:10.1016/j.cmet.2013.02.006
• Antonicka H., Shoubridge E.A. (2015). Mitochondrial RNA granules are centers for posttranscriptional RNA processing and ribosome biogenesis. Cell Rep.: —. PMID 25683715 DOI:10.1016/j.celrep.2015.01.030

Див. також

• Хромосома 4