GSDMB

GSDMB
Ідентифікатори
Символи	GSDMB, GSDML, PRO2521, PP4052, gasdermin B, GSDMB-1
Зовнішні ІД	OMIM: 611221 HomoloGene: 88856 GeneCards: GSDMB
Пов'язані генетичні захворювання
бронхіальна астма
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція • phosphatidylserine binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding • phosphatidylinositol-4-phosphate binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • мембрана • компонент клітини Біологічний процес • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • GO:0022610 життєдіяльність • Піроптоз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55876	н/д
Ensembl	ENSG00000073605	н/д
UniProt	Q8TAX9	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001042471 NM_001165958 NM_001165959 NM_018530 NM_001369402	н/д
RefSeq (білок)	NP_001035936 NP_001159430 NP_001159431 NP_061000 NP_001356331	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 39.9 – 39.92 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

GSDMB (англ. Gasdermin B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 786.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSVFEEITR		IVVKEMDAGG		DMIAVRSLVD		ADRFRCFHLV		GEKRTFFGCR
HYTTGLTLMD		ILDTDGDKWL		DELDSGLQGQ		KAEFQILDNV		DSTGELIVRL
PKEITISGSF		QGFHHQKIKI		SENRISQQYL		ATLENRKLKR		ELPFSFRSIN
TRENLYLVTE		TLETVKEETL		KSDRQYKFWS		QISQGHLSYK		HKGQREVTIP
PNRVLSYRVK		QLVFPNKETM		SAGLDIHFRG		KTKSFPEGKS		LGSEDSRNMK
EKLEDMESVL		KDLTEEKRKD		VLNSLAKCLG		KEDIRQDLEQ		RVSEVLISGE
LHMEDPDKPL		LSSLFNAAGV		LVEARAKAIL		DFLDALLELS		EEQQFVAEAL
EKGTLPLLKD		QVKSVMEQNW		DELASSPPDM		DYDPEARILC		ALYVVVSILL
ELAEGPTSVS		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Фізіологічні властивості

GSDMB вважається унікальним серед інших членів своєї родини, і його роль у різних видах захворювань і ракових захворювань відносно недостатньо вивчена. Було показано, що генетичні варіанти GSDMB пов'язані з підвищеною сприйнятливістю до таких захворювань, як астма та запальні захворювання кишечника (Запальні захворювання кишечника).

Дослідження

Дослідження відбуваються, у проєкті Картування онкологічних маркерів.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carl-McGrath S., Schneider-Stock R., Ebert M., Roecken C. (2008). Differential expression and localisation of gasdermin-like (GSDML), a novel member of the cancer-associated GSDMDC protein family, in neoplastic and non-neoplastic gastric, hepatic, and colon tissues. Pathology. 40: 13—24. PMID 18038310 DOI:10.1080/00313020701716250

Див. також

• Хромосома 17