GYG1

GYG1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3Q4S, 3QVB, 3RMV, 3RMW, 3T7M, 3T7N, 3T7O, 3U2T, 3U2U, 3U2V, 3U2W, 3U2X
Ідентифікатори
Символи	GYG1, GSD15, GYG, glycogenin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603942 MGI: 1351614 HomoloGene: 31219 GeneCards: GYG1
Пов'язані генетичні захворювання
	glycogen storage disease XV
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • glycogenin glucosyltransferase activity; • зв'язування з іоном металу; • glycosyltransferase activity; • UDP-alpha-D-glucose:glucosyl-glycogenin alpha-D-glucosyltransferase activity; • manganese ion binding; • protein homodimerization activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • lysosomal lumen; • екзосома; • мембрана; • extracellular region; • secretory granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen;
Біологічний процес	• Глікогеноліз; • glycogen biosynthetic process; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2992
	27357
	ENSG00000163754
	ENSMUSG00000019528
	P46976
	Q9R062
	NM_004130; NM_001184720; NM_001184721
	NM_013755; NM_001355261
	NP_001171649; NP_001171650; NP_004121
	NP_038783; NP_001342190
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GYG1 (англ. Glycogenin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 39 384^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTDQAFVTLT	TNDAYAKGAL	VLGSSLKQHR	TTRRLVVLAT	PQVSDSMRKV
LETVFDEVIM	VDVLDSGDSA	HLTLMKRPEL	GVTLTKLHCW	SLTQYSKCVF
MDADTLVLAN	IDDLFDREEL	SAAPDPGWPD	CFNSGVFVYQ	PSVETYNQLL
HLASEQGSFD	GGDQGILNTF	FSSWATTDIR	KHLPFIYNLS	SISIYSYLPA
FKVFGASAKV	VHFLGRVKPW	NYTYDPKTKS	VKSEAHDPNM	THPEFLILWW
NIFTTNVLPL	LQQFGLVKDT	CSYVNVLSDL	VYTLAFSCGF	CRKEDVSGAI
SHLSLGEIPA	MAQPFVSSEE	RKERWEQGQA	DYMGADSFDN	IKRKLDTYLQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном марганцю.

Література[ред. | ред. код]

van Maanen M.-H., Fournier P.A., Palmer T.N., Abraham L.J. (1999). Characterization of the human glycogenin-1 gene: identification of a muscle-specific regulatory domain. Gene. 234: 217—226. PMID 10395894 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00211-5
Zhai L., Mu J., Zong H., DePaoli-Roach A.A., Roach P.J. (2000). Structure and chromosomal localization of the human glycogenin-2 gene GYG2. Gene. 242: 229—235. PMID 10721716 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00520-X
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Skurat A.V., Dietrich A.D., Roach P.J. (2006). Interaction between glycogenin and glycogen synthase. Arch. Biochem. Biophys. 456: 93—97. PMID 17055998 DOI:10.1016/j.abb.2006.09.024