HAPLN1

HAPLN1
Ідентифікатори
Символи	HAPLN1, CRTL1, CRT1, hyaluronan and proteoglycan link protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 115435 MGI: 1337006 HomoloGene: 1420 GeneCards: HAPLN1
Пов'язані генетичні захворювання
рак простати
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent • hyaluronic acid binding • extracellular matrix structural constituent conferring compression resistance Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • синапс • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • skeletal system development • extracellular matrix organization • central nervous system development • адгезія клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1404	12950
Ensembl	ENSG00000145681	ENSMUSG00000021613
UniProt	P10915	Q9QUP5
RefSeq (мРНК)	NM_001884	NM_013500
RefSeq (білок)	NP_001875	NP_038528
Локус (UCSC)	Хр. 5: 83.64 – 83.72 Mb	Хр. 13: 89.69 – 89.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HAPLN1 (англ. Hyaluronan and proteoglycan link protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 40 166.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKSLLLLVLI		SICWADHLSD		NYTLDHDRAI		HIQAENGPHL		LVEAEQAKVF
SHRGGNVTLP		CKFYRDPTAF		GSGIHKIRIK		WTKLTSDYLK		EVDVFVSMGY
HKKTYGGYQG		RVFLKGGSDS		DASLVITDLT		LEDYGRYKCE		VIEGLEDDTV
VVALDLQGVV		FPYFPRLGRY		NLNFHEAQQA		CLDQDAVIAS		FDQLYDAWRG
GLDWCNAGWL		SDGSVQYPIT		KPREPCGGQN		TVPGVRNYGF		WDKDKSRYDV
FCFTSNFNGR		FYYLIHPTKL		TYDEAVQACL		NDGAQIAKVG		QIFAAWKILG
YDRCDAGWLA		DGSVRYPISR		PRRRCSPTEA		AVRFVGFPDK		KHKLYGVYCF
RAYN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Dudhia J., Hardingham T.E. (1990). The primary structure of human cartilage link protein. Nucleic Acids Res. 18: 1292—1292. PMID 2320422 DOI:10.1093/nar/18.5.1292
• Dudhia J., Hardingham T.E. (1990). Nucleic Acids Res. 18: 2214—2214. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 2336413 DOI:10.1093/nar/18.8.2214
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Spicer A.P., Joo A., Bowling R.A. Jr. (2003). A hyaluronan binding link protein gene family whose members are physically linked adjacent to chondroitin sulfate proteoglycan core protein genes: the missing links. J. Biol. Chem. 278: 21083—21091. PMID 12663660 DOI:10.1074/jbc.M213100200

Див. також

• Хромосома 5