HECW2

HECW2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LFE
Ідентифікатори
Символи	HECW2, NEDL2, HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, NDHSAL
Зовнішні ІД	OMIM: 617245 MGI: 2685817 HomoloGene: 66192 GeneCards: HECW2
Пов'язані генетичні захворювання
neurodevelopmental disorder with hypotonia, seizures, and absent language; NDHSAL
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • mitotic spindle • веретено поділу • цитоскелет • цитоплазма Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of mitotic metaphase/anaphase transition • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein polyubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • regulation of dendrite morphogenesis • negative regulation of sodium ion transmembrane transporter activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57520	329152
Ensembl	ENSG00000138411	ENSMUSG00000042807
UniProt	Q9P2P5	Q6I6G8
RefSeq (мРНК)	NM_001304840 NM_020760 NM_001348768	NM_001001883 NM_172655
RefSeq (білок)	NP_001291769 NP_065811 NP_001335697	NP_001001883 NP_766243
Локус (UCSC)	Хр. 2: 196.19 – 196.59 Mb	Хр. 1: 53.85 – 54.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HECW2 (англ. HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 572 амінокислот, а молекулярна маса — 175 769.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASSAREHLL		FVRRRNPQMR		YTLSPENLQS		LAAQSSMPEN		MTLQRANSDT
DLVTSESRSS		LTASMYEYTL		GQAQNLIIFW		DIKEEVDPSD		WIGLYHIDEN
SPANFWDSKN		RGVTGTQKGQ		IVWRIEPGPY		FMEPEIKICF		KYYHGISGAL
RATTPCITVK		NPAVMMGAEG		MEGGASGNLH		SRKLVSFTLS		DLRAVGLKKG
MFFNPDPYLK		MSIQPGKKSS		FPTCAHHGQE		RRSTIISNTT		NPIWHREKYS
FFALLTDVLE		IEIKDKFAKS		RPIIKRFLGK		LTIPVQRLLE		RQAIGDQMLS
YNLGRRLPAD		HVSGYLQFKV		EVTSSVHEDA		SPEAVGTILG		VNSVNGDLGS
PSDDEDMPGS		HHDSQVCSNG		PVSEDSAADG		TPKHSFRTSS		TLEIDTEELT
STSSRTSPPR		GRQDSLNDYL		DAIEHNGHSR		PGTATCSERS		MGASPKLRSS
FPTDTRLNAM		LHIDSDEEDH		EFQQDLGYPS		SLEEEGGLIM		FSRASRADDG
SLTSQTKLED		NPVENEEAST		HEAASFEDKP		ENLPELAESS		LPAGPAPEEG
EGGPEPQPSA		DQGSAELCGS		QEVDQPTSGA		DTGTSDASGG		SRRAVSETES
LDQGSEPSQV		SSETEPSDPA		RTESVSEAST		RPEGESDLEC		ADSSCNESVT
TQLSSVDTRC		SSLESARFPE		TPAFSSQEEE		DGACAAEPTS		SGPAEGSQES
VCTAGSLPVV		QVPSGEDEGP		GAESATVPDQ		EELGEVWQRR		GSLEGAAAAA
ESPPQEEGSA		GEAQGTCEGA		TAQEEGATGG		SQANGHQPLR		SLPSVRQDVS
RYQRVDEALP		PNWEARIDSH		GRIFYVDHVN		RTTTWQRPTA		PPAPQVLQRS
NSIQQMEQLN		RRYQSIRRTM		TNERPEENTN		AIDGAGEEAD		FHQASADFRR
ENILPHSTSR		SRITLLLQSP		PVKFLISPEF		FTVLHSNPSA		YRMFTNNTCL
KHMITKVRRD		THHFERYQHN		RDLVGFLNMF		ANKQLELPRG		WEMKHDHQGK
AFFVDHNSRT		TTFIDPRLPL		QSSRPTSALV		HRQHLTRQRS		HSAGEVGEDS
RHAGPPVLPR		PSSTFNTVSR		PQYQDMVPVA		YNDKIVAFLR		QPNIFEILQE
RQPDLTRNHS		LREKIQFIRT		EGTPGLVRLS		SDADLVMLLS		LFEEEIMSYV
PPHALLHPSY		CQSPRGSPVS		SPQNSPGTQR		ANARAPAPYK		RDFEAKLRNF
YRKLETKGYG		QGPGKLKLII		RRDHLLEDAF		NQIMGYSRKD		LQRNKLYVTF
VGEEGLDYSG		PSREFFFLVS		RELFNPYYGL		FEYSANDTYT		VQISPMSAFV
DNHHEWFRFS		GRILGLALIH		QYLLDAFFTR		PFYKALLRIL		CDLSDLEYLD
EEFHQSLQWM		KDNDIHDILD		LTFTVNEEVF		GQITERELKP		GGANIPVTEK
NKKEYIERMV		KWRIERGVVQ		QTESLVRGFY		EVVDARLVSV		FDARELELVI
AGTAEIDLSD		WRNNTEYRGG		YHDNHIVIRW		FWAAVERFNN		EQRLRLLQFV
TGTSSIPYEG		FASLRGSNGP		RRFCVEKWGK		ITALPRAHTC		FNRLDLPPYP
SFSMLYEKLL		TAVEETSTFG		LE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2