HERC5

HERC5
Ідентифікатори
Символи	HERC5, CEB1, CEBP1, HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 608242 HomoloGene: 81848 GeneCards: HERC5
Онтологія гена Молекулярна функція • ISG15 transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transferase activity • RNA binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • ISG15-protein conjugation • negative regulation of type I interferon production • regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • regulation of defense response to virus • defense response to virus • процес імунної системи • protein polyubiquitination • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51191	н/д
Ensembl	ENSG00000138646	н/д
UniProt	Q9UII4	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_016323	н/д
RefSeq (білок)	NP_057407	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 88.46 – 88.51 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

HERC5 (англ. HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 024 амінокислот, а молекулярна маса — 116 852.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERRSRRKSR		RNGRSTAGKA		AATQPAKSPG		AQLWLFPSAA		GLHRALLRRV
EVTRQLCCSP		GRLAVLERGG		AGVQVHQLLA		GSGGARTPKC		IKLGKNMKIH
SVDQGAEHML		ILSSDGKPFE		YDNYSMKHLR		FESILQEKKI		IQITCGDYHS
LALSKGGELF		AWGQNLHGQL		GVGRKFPSTT		TPQIVEHLAG		VPLAQISAGE
AHSMALSMSG		NIYSWGKNEC		GQLGLGHTES		KDDPSLIEGL		DNQKVEFVAC
GGSHSALLTQ		DGLLFTFGAG		KHGQLGHNST		QNELRPCLVA		ELVGYRVTQI
ACGRWHTLAY		VSDLGKVFSF		GSGKDGQLGN		GGTRDQLMPL		PVKVSSSEEL
KLESHTSEKE		LIMIAGGNQS		ILLWIKKENS		YVNLKRTIPT		LNEGTVKRWI
ADVETKRWQS		TKREIQEIFS		SPACLTGSFL		RKRRTTEMMP		VYLDLNKARN
IFKELTQKDW		ITNMITTCLK		DNLLKRLPFH		SPPQEALEIF		FLLPECPMMH
ISNNWESLVV		PFAKVVCKMS		DQSSLVLEEY		WATLQESTFS		KLVQMFKTAV
ICQLDYWDES		AEENGNVQAL		LEMLKKLHRV		NQVKCQLPES		IFQVDELLHR
LNFFVEVCRR		YLWKMTVDAS		ENVQCCVIFS		HFPFIFNNLS		KIKLLHTDTL
LKIESKKHKA		YLRSAAIEEE		RESEFALRPT		FDLTVRRNHL		IEDVLNQLSQ
FENEDLRKEL		WVSFSGEIGY		DLGGVKKEFF		YCLFAEMIQP		EYGMFMYPEG
ASCMWFPVKP		KFEKKRYFFF		GVLCGLSLFN		CNVANLPFPL		ALFKKLLDQM
PSLEDLKELS		PDLGKNLQTL		LDDEGDNFEE		VFYIHFNVHW		DRNDTNLIPN
GSSITVNQTN		KRDYVSKYIN		YIFNDSVKAV		YEEFRRGFYK		MCDEDIIKLF
HPEELKDVIV		GNTDYDWKTF		EKNARYEPGY		NSSHPTIVMF		WKAFHKLTLE
EKKKFLVFLT		GTDRLQMKDL		NNMKITFCCP		ESWNERDPIR		ALTCFSVLFL
PKYSTMETVE		EALQEAINNN		RGFG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, убіквітинування білків, антивірусний захист, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takeuchi T., Inoue S., Yokosawa H. (2006). Identification and Herc5-mediated ISGylation of novel target proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 348: 473—477. PMID 16884686 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.07.076
• Dastur A., Beaudenon S., Kelley M., Krug R.M., Huibregtse J.M. (2006). Herc5, an interferon-induced HECT E3 enzyme, is required for conjugation of ISG15 in human cells. J. Biol. Chem. 281: 4334—4338. PMID 16407192 DOI:10.1074/jbc.M512830200
• Wong J.J., Pung Y.F., Sze N.S., Chin K.C. (2006). HERC5 is an IFN-induced HECT-type E3 protein ligase that mediates type I IFN-induced ISGylation of protein targets. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 10735—10740. PMID 16815975 DOI:10.1073/pnas.0600397103
• Durfee L.A., Lyon N., Seo K., Huibregtsesend J.M. (2010). The ISG15 conjugation system broadly targets newly synthesized proteins: implications for the antiviral function of ISG15. Mol. Cell. 38: 722—732. PMID 20542004 DOI:10.1016/j.molcel.2010.05.002
• Zhao C., Hsiang T.Y., Kuo R.L., Krug R.M. (2010). ISG15 conjugation system targets the viral NS1 protein in influenza A virus-infected cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 2253—2258. PMID 20133869 DOI:10.1073/pnas.0909144107

Див. також

• Хромосома 4