HERC6

HERC6
Ідентифікатори
Символи	HERC6, HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 609249 MGI: 1914388 HomoloGene: 70768 GeneCards: HERC6
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • hematopoietic progenitor cell differentiation • protein polyubiquitination • response to bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55008	67138
Ensembl	ENSG00000138642	ENSMUSG00000029798
UniProt	Q8IVU3	F2Z461
RefSeq (мРНК)	NM_001013000 NM_001013002 NM_001013005 NM_001165136 NM_017912	NM_025992 NM_028861
RefSeq (білок)	NP_001158608 NP_060382	NP_080268
Локус (UCSC)	Хр. 4: 88.38 – 88.44 Mb	Хр. 6: 57.56 – 57.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HERC6 (англ. HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 022 амінокислот, а молекулярна маса — 115 126.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYFCWGADSR		ELQRRRTAGS		PGAELLQAAS		GERHSLLLLT		NHRVLSCGDN
SRGQLGRRGA		QRGELPEPIQ		ALETLIVDLV		SCGKEHSLAV		CHKGRVFAWG
AGSEGQLGIG		EFKEISFTPK		KIMTLNDIKI		IQVSCGHYHS		LALSKDSQVF
SWGKNSHGQL		GLGKEFPSQA		SPQRVRSLEG		IPLAQVAAGG		AHSFALSLCG
TSFGWGSNSA		GQLALSGRNV		PVQSNKPLSV		GALKNLGVVY		ISCGDAHTAV
LTQDGKVFTF		GDNRSGQLGY		SPTPEKRGPQ		LVERIDGLVS		QIDCGSYHTL
AYVHTTGQVV		SFGHGPSDTS		KPTHPEALTE		NFDISCLISA		EDFVDVQVKH
IFAGTYANFV		TTHQDTSSTR		APGKTLPEIS		RISQSMAEKW		IAVKRRSTEH
EMAKSEIRMI		FSSPACLTAS		FLKKRGTGET		TSIDVDLEMA		RDTFKKLTKK
EWISSMITTC		LEDDLLRALP		CHSPHQEALS		VFLLLPECPV		MHDSKNWKNL
VVPFAKAVCE		MSKQSLQVLK		KCWAFLQESS		LNPLIQMLKA		AIISQLLHQT
KTEQDHCNVK		ALLGMMKELH		KVNKANCRLP		ENTFNINELS		NLLNFYIDRG
RQLFRDNHLI		PAETPSPVIF		SDFPFIFNSL		SKIKLLQADS		HIKMQMSEKK
AYMLMHETIL		QKKDEFPPSP		RFILRVRRSR		LVKDALRQLS		QAEATDFCKV
LVVEFINEIC		PESGGVSSEF		FHCMFEEMTK		PEYGMFMYPE		MGSCMWFPAK
PKPEKKRYFL		FGMLCGLSLF		NLNVANLPFP		LALYKKLLDQ		KPSLEDLKEL
SPRLGKSLQE		VLDDAADDIG		DALCIRFSIH		WDQNDVDLIP		NGISIPVDQT
NKRDYVSKYI		DYIFNVSVKA		VYEEFQRGFY		RVCEKEILRH		FYPEELMTAI
IGNTDYDWKQ		FEQNSKYEQG		YQKSHPTIQL		FWKAFHKLTL		DEKKKFLFFL
TGRDRLHARG		IQKMEIVFRC		PETFSERDHP		TSITCHNILS		LPKYSTMERM
EEALQVAINN		NRGFVSPMLT		QS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4