HERPUD1

HERPUD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WGD
Ідентифікатори
Символи	HERPUD1, HERP, Mif1, SUP, homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608070 MGI: 1927406 HomoloGene: 40973 GeneCards: HERPUD1
Пов'язані генетичні захворювання
метаболічні захворювання
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane transporter binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • ubiquitin ligase-substrate adaptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • Lewy body core • Кальцієві канали • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • negative regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • regulation of protein ubiquitination • regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • cellular calcium ion homeostasis • endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis • response to endoplasmic reticulum stress • PERK-mediated unfolded protein response • positive regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process • response to unfolded protein • retrograde protein transport, ER to cytosol • positive regulation of protein binding • Відповідь на незгорнуті білки • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9709	64209
Ensembl	ENSG00000051108	ENSMUSG00000031770
UniProt	Q15011	Q9JJK5
RefSeq (мРНК)	NM_001010989 NM_001010990 NM_001272103 NM_014685	NM_022331 NM_001357205
RefSeq (білок)	NP_001010989 NP_001259032 NP_055500 NP_001259032.1	NP_071726 NP_001344134
Локус (UCSC)	Хр. 16: 56.93 – 56.94 Mb	Хр. 8: 95.11 – 95.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HERPUD1 (англ. Homocysteine inducible ER protein with ubiquitin like domain 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 43 720.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESETEPEPV		TLLVKSPNQR		HRDLELSGDR		GWSVGHLKAH		LSRVYPERPR
PEDQRLIYSG		KLLLDHQCLR		DLLPKQEKRH		VLHLVCNVKS		PSKMPEINAK
VAESTEEPAG		SNRGQYPEDS		SSDGLRQREV		LRNLSSPGWE		NISRPEAAQQ
AFQGLGPGFS		GYTPYGWLQL		SWFQQIYARQ		YYMQYLAATA		ASGAFVPPPS
AQEIPVVSAP		APAPIHNQFP		AENQPANQNA		APQVVVNPGA		NQNLRMNAQG
GPIVEEDDEI		NRDWLDWTYS		AATFSVFLSI		LYFYSSLSRF		LMVMGATVVM
YLHHVGWFPF		RPRPVQNFPN		DGPPPDVVNQ		DPNNNLQEGT		DPETEDPNHL
PPDRDVLDGE		QTSPSFMSTA		WLVFKTFFAS		LLPEGPPAIA		N

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• Kokame K., Agarwala K.L., Kato H., Miyata T. (2000). Herp, a new ubiquitin-like membrane protein induced by endoplasmic reticulum stress. J. Biol. Chem. 275: 32846—32853. PMID 10922362 DOI:10.1074/jbc.M002063200
• Kokame K., Kato H., Miyata T. (2001). Identification of ERSE-II, a new cis-acting element responsible for the ATF6-dependent mammalian unfolded protein response. J. Biol. Chem. 276: 9199—9205. PMID 11112790 DOI:10.1074/jbc.M010486200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim T.Y., Kim E., Yoon S.K., Yoon J.B. (2008). Herp enhances ER-associated protein degradation by recruiting ubiquilins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 369: 741—746. PMID 18307982 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.02.086

Див. також

• Хромосома 16