HHLA1

HHLA1
Ідентифікатори
Символи	HHLA1, PLA2L, HERV-H LTR-associating 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604109 MGI: 3615329 HomoloGene: 129987 GeneCards: HHLA1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10086	654498
Ensembl	ENSG00000132297	ENSMUSG00000072511
UniProt	C9JL84	Q3TYV2
RefSeq (мРНК)	NM_005712 NM_001145095	NM_001145096
RefSeq (білок)	NP_001138567	NP_001138568
Локус (UCSC)	Хр. 8: 132.06 – 132.11 Mb	Хр. 15: 65.79 – 65.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HHLA1 (англ. HERV-H LTR-associating 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 531 амінокислот, а молекулярна маса — 58 297.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGFLSRGPS		MKLCMGLACV		LSLWNTVSGI		KGEAKKEKGM		TFLPTTVSGL
REEERKEKGV		AFLATTELPA		RSIDLSALNL		TELVNGMLSR		ALKDSKKFFS
LLSVTSYSSF		AFHKFSVAVY		NISNLKTVDP		AKFPTRYCYC		LNNRTNDLSD
FTALLVDIIG		NSTSYLTEIF		KSTSILSVNQ		SNESDCIFIC		VMTGKSGRNL
SDFWEIEEKY		PIINYTFTSG		LSGVLGAATR		GTARTSKPTT		KSQKTLPSTS
PGHWTQSTPW		ASALRSSPWT		ETAAPSETEE		TLNTGRPPEL		PARATATWFS
ASHTLPALAT		RRVARTQWLT		ADRQTWASIS		SVPWAQTISE		KKPGGSLWET
RSSPPTTAGT		EEAMNTTSLL		APAAEIMATP		GSPSQASPTL		GAFTHGTQTP
SPTKATAPRY		PQTGDLSAEW		PFTAGEEPVL		VPRPHQVSRC		PQPLFKVGAM
AAAPLTLAIQ		RLNPCLMELC		QFFQQCLCMS		QRSPRTEDMR		YCLEYYSWFL
KNATYICQRV		KRVSHSHTLK		QKCLENICKS		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• Kowalski P.E., Freeman J.D., Mager D.L. (1999). Intergenic splicing between a HERV-H endogenous retrovirus and two adjacent human genes. Genomics. 57: 371—379. PMID 10329003 DOI:10.1006/geno.1999.5787
• Feuchter-Murthy A.E., Freeman J.D., Mager D.L. (1993). Splicing of a human endogenous retrovirus to a novel phospholipase A2 related gene. Nucleic Acids Res. 21: 135—143. PMID 8382789 DOI:10.1093/nar/21.1.135

Див. також

• Хромосома 8